# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00042.fasta.huge -Q ../query/FLJ00042.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00042, 452 aa vs ./tmplib.10216 library 2210542 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7333+/-0.00557; mu= 20.9474+/- 0.376 mean_var=189.4748+/-41.950, 0's: 0 Z-trim: 2 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.093175 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00342 ( 233 res) sf00009 ( 233) 1596 225.8 2.8e-60 KIAA2032 ( 952 res) eh00720 ( 952) 157 33.5 0.089 KIAA0601 ( 886 res) hg00838a ( 886) 122 28.7 2.2 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 120 28.6 3 KIAA0347 ( 1281 res) hg01528(revised) (1281) 118 28.5 3.8 FLJ00016 ( 349 res) as00016 ( 349) 110 26.3 4.5 KIAA1547 ( 863 res) fh14154 ( 863) 113 27.5 5.1 KIAA0482 ( 1332 res) hj01880 (1332) 115 28.1 5.2 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 108 26.1 5.5 KIAA0669 ( 825 res) hk02346 ( 825) 112 27.3 5.5 KIAA0863 ( 1181 res) hk06535 (1181) 112 27.6 6.5 KIAA1433 ( 652 res) hh05535 ( 652) 109 26.7 6.6 FLJ00361 ( 366 res) sh04352 ( 366) 104 25.6 8.1 FLJ00311 ( 249 res) sh06450 ( 249) 101 24.9 9.1 KIAA0945 ( 797 res) hj04760 ( 797) 106 26.5 9.5 KIAA1994 ( 1117 res) bh00052 (1117) 105 26.6 12 KIAA1852 ( 948 res) fj01514 ( 948) 104 26.3 12 KIAA1304 ( 1051 res) fh04032 (1051) 104 26.4 13 KIAA0250 ( 1122 res) ha02790 (1122) 103 26.3 15 FLJ00280 ( 440 res) sh01728 ( 440) 98 24.9 15 KIAA0563 ( 1652 res) fh23589 (1652) 103 26.7 17 KIAA0505 ( 200 res) hh00043 ( 200) 93 23.6 17 KIAA0306 ( 1451 res) hg00063 (1451) 102 26.4 18 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 99 25.7 20 KIAA0212 ( 666 res) ha02602 ( 666) 96 25.0 22 KIAA1909 ( 1287 res) ff10210 (1287) 98 25.8 25 KIAA0717 ( 751 res) fh19258 ( 751) 95 24.9 26 KIAA1100 ( 444 res) hk07907 ( 444) 92 24.1 27 KIAA0940 ( 699 res) hh04894 ( 699) 94 24.8 27 KIAA0518 ( 650 res) hg01059 ( 650) 93 24.6 29 KIAA0290 ( 906 res) ha06644 ( 906) 94 25.0 31 FLJ00007 ( 701 res) as00007 ( 701) 92 24.5 33 KIAA0921 ( 1658 res) ah00573 (1658) 96 25.7 33 KIAA1664 ( 920 res) fj04751s1 ( 920) 93 24.8 34 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 93 24.9 34 FLJ00209 ( 358 res) sj05025 ( 358) 88 23.4 35 KIAA0653 ( 558 res) hk01718 ( 558) 90 24.0 36 KIAA0374 ( 584 res) hh00327 ( 584) 90 24.1 37 KIAA0811 ( 1123 res) hj04806 (1123) 93 25.0 37 FLJ00232 ( 318 res) sj06640 ( 318) 87 23.2 37 KIAA1506 ( 3309 res) ff04330 (3309) 98 26.5 37 FLJ00305 ( 789 res) sh05120 ( 789) 91 24.4 38 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 91 24.5 38 KIAA1193 ( 544 res) fg00739 ( 544) 89 23.9 39 KIAA0284 ( 1573 res) pf09542 (1573) 94 25.4 39 KIAA1064 ( 1315 res) hj05008s1 (1315) 93 25.1 39 KIAA1779 ( 1233 res) hg04229 (1233) 92 24.9 42 KIAA0865 ( 1900 res) hk06640y1 (1900) 94 25.6 42 KIAA0802 ( 1578 res) hh07536 (1578) 93 25.3 43 KIAA0740 ( 696 res) hk03989s1 ( 696) 89 24.1 43 >>FLJ00342 ( 233 res) sf00009 (233 aa) initn: 1618 init1: 1585 opt: 1596 Z-score: 1175.5 bits: 225.8 E(): 2.8e-60 Smith-Waterman score: 1596; 96.218% identity (96.639% similar) in 238 aa overlap (215-452:2-233) 190 200 210 220 230 240 FLJ000 PAGSHVPAGSLTSQPGFAFQIRTKWIPLVNGGTTQGPRVPIILVGNKSDLRSGSSMEAVL :: .:: ::::::::::::::::: FLJ003 TGGPRRGP------VGNKSDLRSGSSMEAVL 10 20 250 260 270 280 290 300 FLJ000 PIMSQFPEIETCVECSAKNLRNISELFYYAQKAVLHPTAPLYDPEAKQLRPACAQALTRI :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ003 PIMSQFPEIETCVECSAKNLRNISELFYYAQKAVLHPTAPLYDPEAKQLRPACAQALTRI 30 40 50 60 70 80 310 320 330 340 350 360 FLJ000 FRLSDQDLDQALSDEELNAFQKSCFGHPLAPQALEDVKTVVCRNVAGGVREDRLTLDGEA :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ003 FRLSDQDLDQALSDEELNAFQKSCFGHPLAPQALEDVKTVVCRNVAGGVREDRLTLDGEA 90 100 110 120 130 140 370 380 390 400 410 420 FLJ000 GCPPVPGECGEGAVPGAPPALSRCRFPLPEHALHPARPARDHLDHPAALRLQRCPGADCG :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ003 GCPPVPGECGEGAVPGAPPALSRCRFPLPEHALHPARPARDHLDHPAALRLQRCPGADCG 150 160 170 180 190 200 430 440 450 FLJ000 LSLPSDPRAPRLQHGAQPPWLPVCAESV :::::::::::::::::::::::::::: FLJ003 LSLPSDPRAPRLQHGAQPPWLPVCAESV 210 220 230 >>KIAA2032 ( 952 res) eh00720 (952 aa) initn: 79 init1: 47 opt: 157 Z-score: 125.3 bits: 33.5 E(): 0.089 Smith-Waterman score: 157; 23.457% identity (46.420% similar) in 405 aa overlap (54-442:561-944) 30 40 50 60 70 80 FLJ000 VSEEATIEKVSPQCRPQQQRHSGRWWPRWTFTQPVASAIAHSILGSLTWSCLTWSHPALS .: :: : .: . .: . : .: KIAA20 AIPTPQRTSTPGLALFPGLPSPVANSTSTPLTLPVQSPLATAASASTSVPVSCGSSASLL 540 550 560 570 580 590 90 100 110 120 130 FLJ000 CDP---TSPERVWGVPQSEPLRPAVLFLPQFPNP---RGGTRRG-PALGAALGLGPSDLG : :: .. ..: . : . : :.: .: .. : :. :. :::. : KIAA20 RGPHPGTSDLHISSTPAATTLPVMIKTEPTSPTPSAFKGPSHSGNPSHGT-LGLS----G 600 610 620 630 640 140 150 160 170 180 190 FLJ000 VFGSHWGQTDEAAPAACLLPPALFLWPGLGPSVGLDLPLLLSPSQAHAPAGSHVP-AGSL ..: . .:. . : ::: .:. .. . :: : . : :: .: : . 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