# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00036.fasta.huge -Q ../query/FLJ00036.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00036, 706 aa vs ./tmplib.10216 library 2210288 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7054+/-0.00426; mu= 18.7218+/- 0.289 mean_var=104.0152+/-22.914, 0's: 0 Z-trim: 5 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.125755 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00002 ( 1513 res) as00002 (1513) 4431 815.1 0 KIAA1520 ( 810 res) ah05473 ( 810) 551 110.8 6.2e-25 KIAA1888 ( 737 res) fk02242 ( 737) 248 55.8 2.1e-08 KIAA0822 ( 1591 res) hh02681 (1591) 251 56.8 2.2e-08 KIAA1062 ( 1771 res) hj03579s1 (1771) 238 54.5 1.2e-07 KIAA0167 ( 844 res) ha01026 ( 844) 102 29.4 2.1 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 95 27.9 4 FLJ00206 ( 702 res) sj04644 ( 702) 94 27.8 5.2 FLJ00359 ( 1056 res) sh03991 (1056) 94 28.1 6.6 KIAA1493 ( 415 res) fj08657 ( 415) 88 26.4 8 KIAA1271 ( 542 res) hk06527 ( 542) 87 26.4 11 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 88 26.8 12 KIAA1762 ( 1460 res) fh27937(revised) (1460) 89 27.3 15 FLJ00230 ( 414 res) sj06557 ( 414) 83 25.5 15 KIAA2020 ( 572 res) ph01249 ( 572) 84 25.9 16 KIAA0290 ( 906 res) ha06644 ( 906) 86 26.5 16 KIAA1951 ( 679 res) fj05532 ( 679) 84 26.0 18 KIAA1200 ( 1403 res) fg02656 (1403) 87 27.0 19 FLJ00041 ( 330 res) as00041 ( 330) 79 24.6 22 KIAA1844 ( 367 res) fj12009 ( 367) 79 24.7 23 KIAA1215 ( 575 res) fh01854 ( 575) 81 25.3 24 FLJ00190 ( 521 res) sj02368 ( 521) 80 25.1 25 KIAA1626 ( 1284 res) fg01925(revised) (1284) 84 26.4 26 KIAA1100 ( 444 res) hk07907 ( 444) 78 24.6 29 KIAA1747 ( 791 res) pj02023 ( 791) 80 25.3 32 KIAA0909 ( 1234 res) hk10471 (1234) 82 26.0 32 KIAA1681 ( 1236 res) fh23697 (1236) 82 26.0 32 KIAA1576 ( 448 res) fj02237 ( 448) 77 24.5 33 KIAA1523 ( 687 res) fh16681(revised) ( 687) 79 25.1 33 KIAA0322 ( 1614 res) hg00462s1 (1614) 83 26.3 33 KIAA1443 ( 573 res) hj01820b ( 573) 78 24.8 34 KIAA1048 ( 897 res) hh02560 ( 897) 80 25.4 34 KIAA0607 ( 731 res) hh00181a ( 731) 79 25.1 35 KIAA0481 ( 732 res) hm00132 ( 732) 79 25.1 35 KIAA1919 ( 403 res) hj08057 ( 403) 76 24.2 35 KIAA0705 ( 1483 res) hg03359s1 (1483) 82 26.1 36 KIAA1715 ( 429 res) hh02382 ( 429) 76 24.3 37 KIAA1409 ( 2461 res) af00533 (2461) 84 26.7 38 KIAA1648 ( 112 res) fg05002 ( 112) 69 22.2 40 KIAA0670 ( 1286 res) hk02359s1 (1286) 80 25.6 43 KIAA1598 ( 446 res) fj09914 ( 446) 75 24.1 43 KIAA0436 ( 689 res) hj00011 ( 689) 77 24.7 43 KIAA0004 ( 1307 res) ha00065 (1307) 80 25.6 43 KIAA0594 ( 1120 res) hj02896s1 (1120) 79 25.4 44 KIAA1690 ( 482 res) fh27434 ( 482) 75 24.1 45 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 78 25.1 46 KIAA1621 ( 787 res) hj04505 ( 787) 77 24.8 46 KIAA0977 ( 1207 res) hj07018 (1207) 79 25.4 46 KIAA0058 ( 181 res) ha01532 ( 181) 70 22.7 47 KIAA0128 ( 424 res) ha03961 ( 424) 74 23.9 47 >>FLJ00002 ( 1513 res) as00002 (1513 aa) initn: 4431 init1: 4431 opt: 4431 Z-score: 4342.5 bits: 815.1 E(): 0 Smith-Waterman score: 4431; 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KIAA15 RNCLFRSLVSQETSFFDENRTGDLISRLTSDTTMVSDLVSQNINVFLRNTVKVTGVVVFM 310 320 330 340 350 360 280 290 300 310 320 FLJ000 GSGLPWLLLLLP----PLSIMYYHVQ-RHYRASSRELRRLGSLTLSPLYSHLADTLAGLS : : : : :. :. .: .. ..:. :.:.. .:. . .:..... KIAA15 FS-LSWQLSLVTFMGFPIIMMVSNIYGKYYKRLSKEVQN----ALARASNTAEETISAMK 370 380 390 400 410 420 330 340 350 360 370 380 FLJ000 VLRATGATYRFEEENLR----LFELNQRCQFATSATMQWLDIRLQLMGAAVVSAIAGIAL ..:. . . : :: ...::.. . :. . : : :. . : : : KIAA15 TVRSFANEEEEAEVYLRKLQQVYKLNRK-EAAAYMYYVW-GSGLTLLVVQVSILYYGGHL 430 440 450 460 470 390 400 410 420 430 440 FLJ000 VQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEAMLVSVERLEEYTCDLPQEPQG : : ... .:... . : . : . .. : .. . ..:.. :. . KIAA15 VISGQ-MTSGNLIAF-IIYEFVLGDCMESVGSVYSGLMQGVGAAEKVFEFI-------DR 480 490 500 510 520 450 460 470 480 490 FLJ000 QPLQLGTGWLT----QGGVEFQDVVLAYRPGLPNA--LDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSG :: .. : :. .: :.:..:...:: :.. :..:.: ..::. ..:: .::: KIAA15 QPTMVHDGSLAPDHLEGRVDFENVTFTYRTR-PHTQVLQNVSFSLSPGKVTALVGPSGSG 530 540 550 560 570 580 500 510 520 530 540 550 FLJ000 KSSLLLVLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLRSQLAIIPQEPFLFSGTVRENLDPQG ::: . .: . .::::::: : . :. .... ::: ::. .. .:.. : KIAA15 KSSCVNILENFYPLEGGRVLLDGKPISAYDHKYLHRVISLVSQEPVLFARSITDNIS-YG 590 600 610 620 630 640 560 570 580 590 600 610 FLJ000 LHK---DRALWQALKQCHLSEVITSMGGLDGELGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKI : . .. : : . .. . : . : :: : .:: ::.: . .::::. . . KIAA15 LPTVPFEMVVEAAQKANAHGFIMELQDGYSTETGEKGAQLSGGQKQRVAMARALVRNPPV 650 660 670 680 690 700 620 630 640 650 660 670 FLJ000 LCIDEATASVDQKTDQLLQQTICKRFANKTVLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDS : .::::...: ... :.::.: . ..::: :::::.:. .. ..::. ::::. . KIAA15 LILDEATSALDAESEYLIQQAIHGNLQKHTVLIIAHRLSTVEHAHLIVVLDKGRVVQQGT 710 720 730 740 750 760 680 690 700 FLJ000 PATLRNQPHSLFQQLLQSSQQGV-PASLGGP : : .:. .:.: .. :. ::. KIAA15 HQQLLAQG-GLYAKLVQRQMLGLQPAADFTAGHNEPVANGSHKA 770 780 790 800 810 >>KIAA1888 ( 737 res) fk02242 (737 aa) initn: 168 init1: 143 opt: 248 Z-score: 244.3 bits: 55.8 E(): 2.1e-08 Smith-Waterman score: 248; 26.066% identity (60.664% similar) in 211 aa overlap (480-683:414-618) 450 460 470 480 490 500 FLJ000 LGTGWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLPNALDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLLVLFR ..:::. :: ::..: .:.:::... .: KIAA18 SIMVSNLHKEYDDKKDFLLSRKVKKVATKYISFCVKKGEILGLLGPNGAGKSTIINILVG 390 400 410 420 430 440 510 520 530 540 550 560 FLJ000 LLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLRSQLAIIPQ-EPFLFSGTVRENLDPQGLHKDRALWQ .::.::.:.: .. : . . .. :: .:. . :..:... : : KIAA18 DIEPTSGQVFLGDYSSETSEDDDSLKCMGYCPQINPLWPDTTLQEHFEIYGAVK------ 450 460 470 480 490 570 580 590 600 610 620 FLJ000 ALKQCHLSEVITSMG-GLDGE--LGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEATAS ... ..:::. . .:: . : . ..: : .. ::.: ..: . .: .:: ... KIAA18 GMSASDMKEVISRITHALDLKEHLQKTVKKLPAGIKRKLCFALSMLGNPQITLLDEPSTG 500 510 520 530 540 550 630 640 650 660 670 680 FLJ000 VDQKTDQLLQQTICKRFANK---TVLTIAHRLNTILNSDRVLVLQAGRVVELDSPATLRN .: :. : . ..: : :. ..:: . .. ::: .. .:.. . . :.. KIAA18 MDPKAKQHMWRAIRTAFKNRKRAAILTTHYMEEAEAVCDRVAIMVSGQLRCIGTVQHLKS 560 570 580 590 600 610 690 700 FLJ000 QPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP . KIAA18 KFGKGYFLEIKLKDWIENLEVDRLQREIQYIFPNASRQESFSSILAYKIPKEDVQSLSQS 620 630 640 650 660 670 >>KIAA0822 ( 1591 res) hh02681 (1591 aa) initn: 214 init1: 138 opt: 251 Z-score: 243.7 bits: 56.8 E(): 2.2e-08 Smith-Waterman score: 251; 27.700% identity (61.033% similar) in 213 aa overlap (476-683:1275-1478) 450 460 470 480 490 500 FLJ000 QPLQLGTGWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLPNALDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLL : .:.:::. :: ::..:..:.:::. . KIAA08 DEKPVIIASCLRKEYAGKRKGCFSKRKNKIATRNVSFCVRKGEVLGLLGHNGAGKSTSIK 1250 1260 1270 1280 1290 1300 510 520 530 540 550 560 FLJ000 VLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQ-LELAQLRSQLAIIPQEPFLFSG-TVRENLDPQGLHKD :. .:..:.::: : .. ::. :. ::: :. . :::..:. . : KIAA08 VITGDTKPTAGQVLLKGSGGGDALEF------LGYCPQENALWPNLTVRQHLEVYAAVK- 1310 1320 1330 1340 1350 570 580 590 600 610 620 FLJ000 RALWQALKQCHLSEVITSMGGLDGELGEGGRSLSLGQRQLLCLARALLTDAKILCIDEAT .: .. . ..... .. :. .: ..:: : .. ::.. ..: . ... .:: . KIAA08 -GLRKGDAEVAITRLVDALK-LQDQLKSPVKTLSEGIKRKLCFVLSILGNPSVVLLDEPS 1360 1370 1380 1390 1400 1410 630 640 650 660 670 680 FLJ000 ASVDQKTDQLLQQTICKRFAN--KTVLTIAHRLNTILN-SDRVLVLQAGRVVELDSPATL ...: . .: . :.: : : . .: .: . ::: .. .::. . : : KIAA08 TGMDPEGQQQMWQAIRATFRNTERGALLTTHYMAEAEAVCDRVAIMVSGRLRCIGSIQHL 1420 1430 1440 1450 1460 1470 690 700 FLJ000 RNQPHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP ... KIAA08 KSKFGKDYLLEMKVKNLAQVEPLHAEILRLFPQAARQERYSSLMVYKLPVEDVQPLAQAF 1480 1490 1500 1510 1520 1530 >>KIAA1062 ( 1771 res) hj03579s1 (1771 aa) initn: 69 init1: 69 opt: 238 Z-score: 230.5 bits: 54.5 E(): 1.2e-07 Smith-Waterman score: 253; 23.891% identity (58.020% similar) in 293 aa overlap (416-706:293-566) 390 400 410 420 430 440 FLJ000 VQHQQGLANPGLVGLSLSYALSLTGLLSGLVSSFTQTEAMLVSVERLEEYTCDLPQEPQG .: . . .: . .:.:: : . .:: KIAA10 WYFPLQKSYWLGSGRTEAWEWSWPWARTPRLSVMEEDQACAMESRRFEE-TRGMEEEPTH 270 280 290 300 310 320 450 460 470 480 490 500 FLJ000 QPLQLGTGWLTQGGVEFQDVVLAYRPGLPNALDGVTFCVQPGEKLGIVGRTGSGKSSLLL :: . . ::. .:. ::. ... . .. ....:..:.::.. . KIAA10 LPLVVCVDKLTK----------VYKDDKKLALNKLSLNLYENQVVSFLGHNGAGKTTTMS 330 340 350 360 370 510 520 530 540 550 560 FLJ000 VLFRLLEPSSGRVLLDGVDTSQLELAQLRSQLAIIPQEPFLFSG-TVRENLDPQGLHKDR .: :. :.:: . . : : . :. ..:..:.. ::. ::. ::.:.: . . 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KIAA10 GVDPYARRAIWDLILKYKPGRTILLSTHHMDEADLLGDRIAIISHGKLKCCGSPLFLKGT 490 500 510 520 530 540 690 700 FLJ000 PHSLFQQLLQSSQQGVPASLGGP . .. : . :: ::: KIAA10 YGDGYRLTLVKR----PAEPGGPQEPGLASSPPGRAPLSSCSELQVSQFIRKHVASCLLV 550 560 570 580 590 600 >>KIAA0167 ( 844 res) ha01026 (844 aa) initn: 86 init1: 57 opt: 102 Z-score: 100.6 bits: 29.4 E(): 2.1 Smith-Waterman score: 104; 26.471% identity (53.431% similar) in 204 aa overlap (461-640:48-237) 440 450 460 470 480 FLJ000 RLEEYTCDLPQEPQGQPLQLGTGWLTQGGVEFQDVVLA----YRPGLPNALDGVTFCVQP :.:: . : : .. :. . . : KIAA01 AAVRAEVRRHEVAKQALNRLRKLAERVDDPELQDSIQASLDSIREAVINSQEWTLSRSIP 20 30 40 50 60 70 490 500 510 520 530 FLJ000 GEKLGIVGRTGSGKSSLLLVL----FRLLEPSSGR-----VLLDGVDTSQLELAQLRSQL .::..: . ::::::. . ...:: . .. .:.:: : .:. .: . 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