# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00025.fasta.huge -Q ../query/FLJ00025.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00025, 955 aa vs ./tmplib.10216 library 2210039 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.2686+/-0.00395; mu= 19.2786+/- 0.267 mean_var=93.7834+/-20.898, 0's: 0 Z-trim: 11 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.132438 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1336 ( 1219 res) bg00080 (1219) 207 51.1 1.2e-06 KIAA1179 ( 1090 res) hh05402a (1090) 192 48.1 8.4e-06 KIAA1435 ( 415 res) hh13841 ( 415) 162 41.8 0.00026 KIAA0993 ( 1556 res) bf03014 (1556) 161 42.4 0.00062 KIAA1736 ( 1244 res) ph00725 (1244) 142 38.6 0.0068 KIAA1449 ( 680 res) fk04105 ( 680) 133 36.6 0.016 KIAA1261 ( 787 res) hh15855b ( 787) 128 35.7 0.033 KIAA1547 ( 863 res) fh14154 ( 863) 128 35.7 0.035 KIAA1397 ( 686 res) hj08255 ( 686) 123 34.6 0.06 KIAA0596 ( 1531 res) hg01605 (1531) 126 35.7 0.063 KIAA0449 ( 1628 res) ff06247 (1628) 123 35.2 0.098 KIAA0541 ( 1500 res) fg05763 (1500) 110 32.7 0.52 KIAA0124 ( 682 res) ha01534 ( 682) 104 31.0 0.74 KIAA1708 ( 1657 res) fj17878y1 (1657) 106 32.0 0.94 KIAA1892 ( 476 res) fk04164 ( 476) 100 30.0 1 KIAA0696 ( 550 res) hk04053 ( 550) 98 29.7 1.4 KIAA1988 ( 636 res) fk07519s1 ( 636) 98 29.8 1.6 KIAA1638 ( 905 res) fj04819s1 ( 905) 99 30.2 1.7 KIAA0893 ( 974 res) hk08702 ( 974) 99 30.3 1.8 KIAA1242 ( 504 res) fh10406 ( 504) 96 29.3 1.8 FLJ00081 ( 333 res) as00081 ( 333) 94 28.7 1.9 FLJ00182 ( 938 res) sj01566 ( 938) 96 29.7 2.6 KIAA0413 ( 1237 res) hh00077s1 (1237) 97 30.0 2.6 KIAA0590 ( 1468 res) hj02755 (1468) 94 29.6 4.3 KIAA0850 ( 644 res) hk05995 ( 644) 89 28.1 5.2 KIAA1950 ( 535 res) fj03308 ( 535) 88 27.8 5.4 KIAA1624 ( 599 res) fg02331 ( 599) 88 27.9 5.7 KIAA1641 ( 718 res) fj10609s1 ( 718) 87 27.8 7.2 KIAA0848 ( 988 res) hk05607 ( 988) 88 28.2 7.6 KIAA1645 ( 386 res) fg04139 ( 386) 83 26.6 8.6 KIAA0531 ( 999 res) hg03072 ( 999) 86 27.8 10 KIAA1374 ( 764 res) fj04345 ( 764) 84 27.3 11 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 83 27.1 13 FLJ00329 ( 349 res) sj02919 ( 349) 79 25.8 14 KIAA0800 ( 1521 res) hg03850s1 (1521) 84 27.7 16 KIAA1422 ( 1151 res) hk10484(revised) (1151) 82 27.1 18 KIAA1972 ( 576 res) fk09334 ( 576) 79 26.1 18 KIAA1404 ( 1925 res) eg01672 (1925) 84 27.8 19 KIAA0353 ( 1614 res) hg01758y1 (1614) 83 27.5 19 KIAA1544 ( 1028 res) fh02556 (1028) 81 26.9 20 KIAA1473 ( 574 res) fj03262 ( 574) 78 25.9 21 FLJ00339 ( 472 res) sj06421 ( 472) 77 25.6 21 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 81 27.1 25 KIAA0540 ( 2041 res) pg00116 (2041) 82 27.5 25 KIAA1720 ( 421 res) pf00447 ( 421) 75 25.2 26 KIAA0201 ( 949 res) ha03256 ( 949) 78 26.3 28 KIAA1104 ( 636 res) fh00160(revised) ( 636) 76 25.6 29 FLJ00341 ( 2760 res) sf00005 (2760) 82 27.7 30 KIAA0456 ( 1095 res) hg00633 (1095) 78 26.3 30 KIAA1105 ( 730 res) hh02687(revised) ( 730) 76 25.7 31 >>KIAA1336 ( 1219 res) bg00080 (1219 aa) initn: 231 init1: 100 opt: 207 Z-score: 212.5 bits: 51.1 E(): 1.2e-06 Smith-Waterman score: 294; 19.372% identity (51.299% similar) in 924 aa overlap (35-838:97-993) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 AEHCINDIAFKPDGTQLILAAGSRLLVYDTSDGTLLQPLKGHKDTVYCVAYAKDGKRFAS :. .. : :.::. .: :.. .. ..... 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KIAA11 THLHLGKELEAEGRLQE---AEYHYLEAQEWKATVNMYRASGLWEEAYRVARTQGGANAH 380 390 400 410 420 750 760 770 780 790 FLJ000 PLLLCATYLKKLDSPGYAAETYL-KMGDLKSLVQLHVETQRWDEAF-----ALGEKHPEF . .:: . : :: : :.: :.. :. ... .. :: :: .: :: KIAA11 KHV---AYLWAKSLGGEAAVRLLNKLGLLEAAVDHAADNCSFEFAFELSRLALKHKTPE- 430 440 450 460 470 480 800 810 820 830 840 850 FLJ000 KDDIYMPYAQWLAENDRFEEAQKAFHKAGRQREAVQVLEQLTNNAVAESRFNDAAYYYWM ... ::..: .. .::::. : .::. .::: KIAA11 ---VHLKYAMFLEDEGKFEEAEAEFIRAGKPKEAVLMFVHNQDWEAAQRVAEAHDPDSVA 490 500 510 520 530 540 860 870 880 890 900 910 FLJ000 LSMQCLDIAQDPAQKDTMLGKFYHFQRLAELYHGYHAIHRHTEDPFSVHRPETLFNISRF KIAA11 EVLVGQARGALEEKDFQKAEGLLLRAQRPGLALNYYKEAGLWSDALRICKDYVPSQLEAL 550 560 570 580 590 600 >>KIAA1435 ( 415 res) hh13841 (415 aa) initn: 130 init1: 97 opt: 162 Z-score: 170.8 bits: 41.8 E(): 0.00026 Smith-Waterman score: 162; 32.967% identity (61.538% similar) in 91 aa overlap (29-114:186-275) 10 20 30 40 50 FLJ000 GRVGAEHCINDIAFKPDGTQLILAAGSRLLVYDTSDGTLLQPLKGHKDTVYCVAYAKD :: . . ... ::::. .: :. . 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KIAA14 NMDVSREEAPQWLESDSCQKCEQPFFWNIKQMWDTKTLGLRQHHCRKCGQAVCGKCSSKR 280 290 300 310 320 330 >>KIAA0993 ( 1556 res) bf03014 (1556 aa) initn: 160 init1: 101 opt: 161 Z-score: 163.9 bits: 42.4 E(): 0.00062 Smith-Waterman score: 166; 28.226% identity (58.871% similar) in 124 aa overlap (38-150:1148-1271) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 CINDIAFKPDGTQLILAAGSRLLVYDTSDGTLLQPLKGHKDTVYCVAYAKDGKRFASGSA :: : : :: ::: :.. . . ..::: KIAA09 PNPKLVITGGTSTVVCVWEMGTSKEKAKTVTLKQALLGHTDTVTCATASLAYHIIVSGSR 1120 1130 1140 1150 1160 1170 70 80 90 100 110 120 FLJ000 DKSVIIWT-SKLEGILKYT-HNDAIQCVSYNPITHQLASCSSSDFGLWSPEQKSVSKHKS :.. ::: .:: . . : .. . : .: ...::... . .:: . . . . .. KIAA09 DRTCIIWDLNKLSFLTQLRGHRAPVSALCINELTGDIVSCAGTYIHVWSINGNPIVSVNT 1180 1190 1200 1210 1220 1230 130 140 150 160 170 FLJ000 ----SSKIICCSWTN----DGQ-YLALGMFNGIISIRNKNGEEKVKIERPGGSLSPIWSI :..:::: .. : : .. : .:.. 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KIAA05 RSKAGNRREDLSSKVTLEKVLGITVSGGRGLACDPRSGLVAYPAGCVVVLFNPRKHKQHH 50 60 70 80 90 100 50 60 70 80 90 FLJ000 PLKGHKDTVYCVAYAKDGKRFASGSADK--SVIIWTSKLEGILK--YTHNDAIQCVSYNP :.. . :. .:.. ::: ...: . . .: .: .. . :. .. ::...: KIAA05 ILNSSRKTITALAFSPDGKYLVTGESGHMPAVRVWDVAEHSQVAELQEHKYGVACVAFSP 110 120 130 140 150 160 100 110 120 130 140 150 FLJ000 ITHQLASCS-SSDF--GLWSPEQK-SVSKHKSSSKIICCSWTNDGQYLAL-GMFNGIISI .. ..: . . :. ..:. ... :...: ::.. :...: .:.. : . . KIAA05 SAKYIVSVGYQHDMIVNVWAWKKNIVVASNKVSSRVTAVSFSEDCSYFVTAGNRHIKFWY 170 180 190 200 210 220 160 170 180 190 200 210 FLJ000 RNKNGEEKVKIERPGGSLSPIWSICWNPSREERNDILAVADWGQKVSFYQLSGKQIGKDR . . ::. : . : . . : ::.... . :. :: KIAA05 LDDSKTSKVNATVPLLGRSGLLG-------ELRNNLFTDVACGR------------GKKA 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 FLJ000 ALNFDPCCISYFTKGEYILLGGSDKQVSLFTKDGVRLGTVGEQNSWVWTCLAKPDSNYVV .: ::. ..: .: ::.. :. : :.: .. .. : :.. ...:. KIAA05 DSTF---CIT--SSG--LLCEFSDRR--LLDK-WVELRNIDSFTTTVAHCISV-SQDYIF 270 280 290 300 310 280 290 300 310 320 330 FLJ000 VGCQDGTISFYQLIFSTVHGLYKDRYAYRDSMTDVIVQHLITEQKVRIKCKELVKKIAIY :: :::. .. KIAA05 CGCADGTVRLFNPSNLHFLSTLPRPHALGTDIASVTEASRLFSGVANARYPDTIALTFDP 320 330 340 350 360 370 955 residues in 1 query sequences 2210039 residues in 2457 library sequences Tcomplib [34.26] (2 proc) start: Fri Feb 27 10:27:30 2009 done: Fri Feb 27 10:27:31 2009 Total Scan time: 0.770 Total Display time: 0.220 Function used was FASTA [version 34.26.5 April 26, 2007]