# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00020.fasta.huge -Q ../query/FLJ00020.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00020, 1142 aa vs ./tmplib.10216 library 2209852 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2218+/-0.00844; mu= -7.1899+/- 0.565 mean_var=522.4526+/-119.627, 0's: 0 Z-trim: 10 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.056111 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 39, opt: 27, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00281 ( 1495 res) sh01915 (1495) 7087 589.2 1.8e-168 FLJ00093 ( 977 res) as00093 ( 977) 6227 519.3 1.3e-147 KIAA1968 ( 860 res) fk04713 ( 860) 3612 307.6 6.2e-84 FLJ00356 ( 851 res) sh02495 ( 851) 3519 300.0 1.1e-81 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 251 35.6 0.058 KIAA0339 ( 1709 res) hg01304(revised) (1709) 239 34.9 0.15 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 218 32.9 0.36 KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217) 213 32.6 0.52 KIAA1760 ( 2219 res) af00030 (2219) 215 33.1 0.68 KIAA0458 ( 1552 res) ef01252 (1552) 208 32.3 0.8 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 200 31.5 0.97 KIAA1866 ( 1783 res) pf09734 (1783) 203 32.0 1.2 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 191 30.6 1.4 KIAA0819 ( 989 res) hh01037 ( 989) 191 30.7 1.6 FLJ00248 ( 501 res) sj08681 ( 501) 176 29.1 2.4 KIAA0618 ( 1052 res) hg03971 (1052) 184 30.2 2.4 KIAA0722 ( 1066 res) hk02030s1 (1066) 181 29.9 2.9 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 169 28.6 3.7 KIAA1297 ( 2242 res) fg03883 (2242) 179 30.2 5.2 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 174 29.7 5.9 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 171 29.3 6.1 KIAA0346 ( 1682 res) hg01508s1 (1682) 172 29.5 6.4 KIAA0771 ( 948 res) hk05113 ( 948) 165 28.6 6.6 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 161 28.2 7.5 FLJ00253 ( 349 res) sj09455 ( 349) 150 26.8 8.1 KIAA1139 ( 1124 res) hk00330 (1124) 163 28.5 8.2 KIAA1306 ( 1154 res) fh05845 (1154) 163 28.5 8.3 KIAA1870 ( 832 res) hh05136b ( 832) 159 28.0 8.5 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 142 25.9 9.2 KIAA1887 ( 967 res) fk02232 ( 967) 158 28.0 9.9 KIAA1858 ( 2469 res) ae00147 (2469) 168 29.3 10 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 148 26.9 11 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 157 28.0 12 KIAA0208 ( 748 res) ha02713 ( 748) 150 27.3 13 KIAA1071 ( 675 res) hj05664s2 ( 675) 148 27.0 14 KIAA0268 ( 1193 res) ha07061 (1193) 154 27.8 14 KIAA0680 ( 635 res) hk02746 ( 635) 146 26.8 15 KIAA0867 ( 568 res) hk06783 ( 568) 144 26.6 15 KIAA1883 ( 1480 res) fh02249 (1480) 154 27.9 16 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 162 29.0 16 KIAA1662 ( 1653 res) fj03879s1 (1653) 155 28.1 16 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 151 27.6 17 KIAA1986 ( 334 res) pg00636 ( 334) 136 25.7 17 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 146 27.0 17 KIAA0079 ( 1102 res) ha03543 (1102) 148 27.3 19 KIAA1914 ( 460 res) fk06306 ( 460) 138 26.0 19 KIAA1543 ( 917 res) hh05613a ( 917) 145 27.0 20 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 146 27.1 21 FLJ00260 ( 922 res) sh05833 ( 922) 144 26.9 21 KIAA1509 ( 1365 res) fh14721 (1365) 148 27.4 21 >>FLJ00281 ( 1495 res) sh01915 (1495 aa) initn: 7087 init1: 7087 opt: 7087 Z-score: 3117.8 bits: 589.2 E(): 1.8e-168 Smith-Waterman score: 7087; 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KIAA03 GT---PYTSRGSTPYSQDSAYSSSTTSTSFKPRR-SENSYQDAFSRRHFSASSA---STT 280 290 300 310 320 710 720 730 740 750 760 FLJ000 PNFSLERTLAAEMAVPGSEFE-GHKRISEQPLPNKTISPPPAPAPAAAPLPCGPTETIPS . .. : :: . .: . . : . .. . : :: . . : KIAA03 ASTAIAATTAATASSSASSSSLSSSSSSSSSSSSSQFRSSDANYPAYYE-SWNRYQRHTS 330 340 350 360 370 380 770 780 790 800 810 820 FLJ000 FLLTRAGRDQAI-CELQEEVSRLRLRLEDSLHQPLQGSPTRPASAFDRPARTRGQPADSP . :: :.. . :.... :. : . : :.::.. :: ... : . : KIAA03 YPPRRATREEPPGAPFAENTAE---RFPPSYTSYLPPEPSRPTDQDYRPPASEAPPPEPP 390 400 410 420 430 440 830 840 850 860 870 880 FLJ000 ATWGSHYGSKSTERLPGEPRGEEQIVPPGRQRARSSSVPREVLRLSL--SSESELPSLPL :. :. :. : : . : . :::.: :. :. ...: : : KIAA03 EPGGGGGGGG-----PSPEREEVRTSPRPASPARSGSPAPETTNESVPFAQHSSLDSRIE 450 460 470 480 490 890 900 910 920 930 940 FLJ000 FSEKSKTTKDSPQAARDGKRGVGSAGWPDRVTFRGQYTGHEYHVLSPKAVPKGNGTVSC- . : . .: : :. .. .:. ... .. :: : ::.:.: : KIAA03 MLLKEQRSKFSFLASDTEEEEENSS-----MVLGARDTGSE--------VPSGSGHGPCT 500 510 520 530 540 950 960 970 980 990 1000 FLJ000 PHCRPIRTQDAGGAVTGDPLGPPPADTLQCPLCGQVGSPPEADGPGSATSGAEKATTRRK : : .:. : ::. : : : . :: . : ..: : ... . 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KIAA15 TFVGRSTGTRAPP----LTRPMSLAVPGLTGGAGPAEPLSPAMSIS-PQATYLSKLIPHA 260 270 280 290 300 430 440 450 460 470 480 FLJ000 PCPLHVNVEVSSGNSEVEDRPQDPLARLRHKELQMEQVYHGLMERYLSVKSLPEAMRMEE : :.: :. : .. :.: . . .: . :. ::.: :. : .. KIAA15 VLPPTVDV-VALGRCSLRT-----LSRCSLHSASPASVRS--LGRFSSVSS-PQP-RSRH 310 320 330 340 350 490 500 510 520 530 FLJ000 EEEGEEEEEEEGGGDSLEVDGVA-----ATPGKAEATR----VLPRQCPVQAEKSHGAP- . . . ..:.. :: . .. :. :.. :.: : :. ...:.: KIAA15 PSSSSDTWSHSQSSDTIVSDGSTLSSKGGSEGQPESSTASNSVVP---PPQGGSGRGSPS 360 370 380 390 400 410 540 550 560 570 FLJ000 ---LEEATEKM------------VSMK-------PPGFQASLARDGHMSGLGKAEAAPPG ::.. . ::.. :: :: :. :: :.: : KIAA15 GGSTAEASDTLSIRSSGQLSGRSVSLRKLKRPPPPPRRTHSL----HQRGL----AVPDG 420 430 440 450 460 580 590 600 610 620 FLJ000 P-GVPPHPPGTKSAASHQSSMTS-LEGSGISERLPQKPLHRGGGPHLEETWMASPETDSG : :.::.: .. . :. ::.: . : .: . . : : : . 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KIAA15 APQ-KPLRRALSGRA---SPV-PAPSSGLHAAVRLKACSLAASEGLSSAQPNGPPEAEPR 860 870 880 890 900 910 990 1000 1010 1020 1030 FLJ000 ---GPGSATS-----GAEKATTRRK-APSTPSPKQRSKQAG----SSPRPPPGLWYLATA .:.:..: :..: .: .: : . ::. : : ::: : KIAA15 PPQSPASTASFIFSKGSRKLQLERPVSPETQADLQRNLVAELRSISEQRPPQ-----APK 920 930 940 950 960 1040 1050 1060 1070 1080 1090 FLJ000 PPAPAPPAFAYISSVPIMPYPPAAVYYAPAGPTSAQPAAKWPPTASPPPARRHRHSIQLD ::: : :: . : :::. : : : .: :. : : KIAA15 KSPKAPPPVARKPSVGV-P-PPASPSYPRAEPLTAPPTNGLPHTQDRTKRELAENGGVLQ 970 980 990 1000 1010 1020 1100 1110 1120 1130 1140 FLJ000 LGDLEELNKALSRAVQAAESVRSTTRQMRSSLSADLRQAHSLRGSCLF KIAA15 LVGPEEKMGLPGSDSQKELA 1030 1040 >>KIAA1205 ( 1217 res) fg03511a (1217 aa) initn: 133 init1: 133 opt: 213 Z-score: 111.5 bits: 32.6 E(): 0.52 Smith-Waterman score: 315; 24.521% identity (40.741% similar) in 783 aa overlap (366-1084:4-712) 340 350 360 370 380 390 FLJ000 GRFDPRRELEAEIYRLGSCLEELKEHIDQTQQEPE-PPGSDSALDSTPALPC---LHQPT .: : ::: . : : :. . 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KIAA12 AEPLGLIQSGPHQAAPPPP--PPPPPPPAPASEPKGGLTS----PIFCSTKPKKLLKTSS 210 220 230 240 250 620 630 640 650 660 670 FLJ000 PHLEETWMASPETDSGFVGSETSRVSPLTQTPEHRLSHISTAGTLAQPFAASVPRDGASY :: : .: :::.. :: . . .: :. KIAA12 FHL------------------LRRRDPPFQTPKK---------LYAQEYEFEADEDKADV 260 270 280 290 680 690 700 710 720 730 FLJ000 PKARGSLIPRRATEPSTPRSQAQRYLSSPSGPLRQRAPNFSLERTLAAEMAVPGSEFEGH : : : ::: :. : .: :: : . :: :: .: KIAA12 P-ADIRLNPRRL--PDLVSSCRSRPALSPLGDIDFCPPN-------------PGP--DGP 300 310 320 330 740 750 760 770 780 FLJ000 KRISEQPLPNKTISPP-----PAPAPAAAPLPCGP-TETIPSFLLTRA-GRDQAICELQE .: ...: : .:: : : .: :: . . :. . :: .. . : KIAA12 RRRGRKPTKAKRDGPPRPRGRPRIRPLEVPTTAGPASASTPTDGAKKPRGRGRGRGRKAE 340 350 360 370 380 390 790 800 810 820 830 FLJ000 EVSRLRLR----LEDSLHQPLQGSPTRPASAFDRPARTRGQPADSPATWGSHYGS--KST :.. ::. :. .: : : .:. : . : . :: : . .. . 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