# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00019.fasta.huge -Q ../query/FLJ00019.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00019, 732 aa vs ./tmplib.10216 library 2210262 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7703+/-0.00752; mu= 2.0312+/- 0.505 mean_var=354.6396+/-80.039, 0's: 0 Z-trim: 1 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.068105 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 38, opt: 26, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0375 ( 1540 res) hh00360s1 (1540) 178 31.9 0.69 KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174) 149 28.9 4.2 KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 ( 503) 140 27.5 4.7 KIAA1249 ( 949 res) hh04184 ( 949) 145 28.4 4.9 FLJ00139 ( 585 res) sh03241 ( 585) 139 27.5 5.5 KIAA0969 ( 1091 res) hj06525 (1091) 142 28.2 6.5 FLJ00353 ( 1766 res) sh01144 (1766) 143 28.5 8.1 KIAA0927 ( 1001 res) hg03734 (1001) 137 27.6 8.7 KIAA1224 ( 997 res) fh02652 ( 997) 134 27.3 11 KIAA0749 ( 678 res) hk04328 ( 678) 130 26.7 11 KIAA0269 ( 567 res) ha06751 ( 567) 126 26.2 13 KIAA1113 ( 1131 res) hj06379(revised) (1131) 132 27.2 13 KIAA0653 ( 558 res) hk01718 ( 558) 125 26.1 14 FLJ00404 ( 261 res) sj07851 ( 261) 118 25.0 14 FLJ00287 ( 186 res) sh02562 ( 186) 113 24.3 16 KIAA0495 ( 209 res) hg00106 ( 209) 114 24.5 16 KIAA1802 ( 821 res) fj21631 ( 821) 123 26.1 20 FLJ00417 ( 600 res) sj06336 ( 600) 120 25.7 20 KIAA0097 ( 2038 res) ha00943(revised) (2038) 130 27.3 21 FLJ00222 ( 656 res) sj06165 ( 656) 120 25.7 22 KIAA1819 ( 1173 res) hh00456 (1173) 125 26.5 22 KIAA1071 ( 675 res) hj05664s2 ( 675) 120 25.7 22 KIAA1860 ( 689 res) fh18358 ( 689) 119 25.6 24 KIAA0904 ( 1535 res) ha00554 (1535) 126 26.8 24 KIAA1076 ( 804 res) hj06779 ( 804) 120 25.8 24 KIAA1940 ( 821 res) ah04227 ( 821) 120 25.8 24 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 122 26.2 25 KIAA1100 ( 444 res) hk07907 ( 444) 114 24.9 26 KIAA1856 ( 1134 res) fh03203 (1134) 122 26.2 26 KIAA0595 ( 1666 res) hj02929s1 (1666) 125 26.7 27 KIAA0672 ( 824 res) hk02382 ( 824) 118 25.6 28 KIAA0910 ( 1315 res) hg02207s1 (1315) 122 26.3 28 FLJ00414 ( 1129 res) sg00016 (1129) 120 26.0 30 KIAA1172 ( 929 res) hj03919(revised) ( 929) 118 25.7 30 KIAA0450 ( 1182 res) hj05822 (1182) 120 26.0 30 KIAA1096 ( 1919 res) pf00402 (1919) 124 26.7 31 KIAA1745 ( 893 res) pj01678 ( 893) 117 25.6 32 KIAA0304 ( 2415 res) af07172 (2415) 125 27.0 33 KIAA1522 ( 1044 res) fh14706(revised) (1044) 117 25.7 35 KIAA1075 ( 1505 res) hj06716s1 (1505) 120 26.2 35 KIAA0490 ( 135 res) hh00727 ( 135) 98 22.6 37 KIAA0881 ( 1064 res) hk07534 (1064) 116 25.6 37 KIAA1471 ( 1421 res) fj02383s1 (1421) 118 26.0 39 KIAA1375 ( 546 res) fj04426 ( 546) 109 24.5 40 KIAA0309 ( 3053 res) hg00096s1 (3053) 124 27.0 41 FLJ00369 ( 700 res) sh06511 ( 700) 111 24.9 41 KIAA1902 ( 1112 res) hj04383 (1112) 114 25.4 44 FLJ00386 ( 811 res) sj04204 ( 811) 111 24.9 45 KIAA1019 ( 2309 res) fg00188s1 (2309) 120 26.4 45 KIAA1734 ( 1313 res) ph00331 (1313) 115 25.6 45 >>KIAA0375 ( 1540 res) hh00360s1 (1540 aa) initn: 161 init1: 68 opt: 178 Z-score: 109.3 bits: 31.9 E(): 0.69 Smith-Waterman score: 178; 28.571% identity (42.471% similar) in 259 aa overlap (475-708:634-863) 450 460 470 480 490 500 FLJ000 DFPEERTPERAQGGSFRSLRSWLISEGYATGPDDISPDWSPEQCPPEPMEPASPAPTPTS ::: :: :: . : : : :.. 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KIAA03 SASTSCSPP----PEQP-TATESLPPWSHSCPSAVRPATSQQPQKEDQKILTLTEYRLHG 820 830 840 850 860 870 720 730 FLJ000 CFFPGSAIGSALS KIAA03 TGSLPPLGSWRSGLSRAESLARGGGEGSMATRPSNANHLSPQALKWREYRRKNPLGPPGL 880 890 900 910 920 930 >>KIAA0754 ( 1174 res) hh06485 (1174 aa) initn: 125 init1: 74 opt: 149 Z-score: 95.1 bits: 28.9 E(): 4.2 Smith-Waterman score: 177; 28.094% identity (44.147% similar) in 299 aa overlap (435-717:784-1054) 410 420 430 440 450 460 FLJ000 LYDTGALGRLQALGLVPLLAGQLCGEAGEEEEEGREAASWDFPEERTPERAQGGSFRSLR :: ::. ::: : : . . KIAA07 VPTPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPPPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPT 760 770 780 790 800 810 470 480 490 500 510 FLJ000 SWLISEGYATGPDDISPDWSPEQCPPEPMEPASPA---PTPTSLRAPR----TQRTPGRS : :. : : :: : : ::.::: ::: .: : . :. : KIAA07 S-----PAAAVPTPEEPT-SPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPTSPAAAVPTPEEPA-S 820 830 840 850 860 520 530 540 550 560 570 FLJ000 PAAAIEEPWGREGPALLLLSRFSQAPDPSGALVTGPALYGLLTYVTGAPGPPSPRALRIL ::::. : : :: : . .: : .::. ...: . :.:. KIAA07 PAAAVPTP---EEPA----SPAAAVPTPEEPAFPAPAVPTPEESASAAVAVPTPEE---- 870 880 890 900 910 580 590 600 610 620 630 FLJ000 SRLTCNPACLEAFVRSYGAALLRAWLVLGVAPDDWPAPRARPTLHSRHRELGEFPYPPVS . .:: : : . . . : .: . :: . :: . : :: : .: KIAA07 ---SASPA---AAVPTPAESASFAAVVATLEEPTSPAASV-PTPAAMVATLEEFTSPAAS 920 930 940 950 960 640 650 660 670 680 FLJ000 LPPCESPSSPMASMG-PE-PHLPTHLSSPARPPDN-----LSPEW--GGEQGVPVPPWAH .: : :.: :... :: : :. . : . :.:: . .::.: KIAA07 VPTSEEPASLAAAVSNPEEPTSPAAAVPTLEEPTSSAAAVLTPEELSSPAASVPTPEEPA 970 980 990 1000 1010 1020 690 700 710 720 730 FLJ000 RQSSAVSSALALGPRYPNSRCSPAPRIWAGLCFFPGSAIGSALS ..:::. : : . :.:.. : KIAA07 SPAAAVSNLEE--PASPAA-AVPTPEVAAIPAASVPTPEVPAIPAAAVPPMEEVSPIGVP 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA0900 ( 503 res) hk09606s1 (503 aa) initn: 147 init1: 70 opt: 140 Z-score: 94.3 bits: 27.5 E(): 4.7 Smith-Waterman score: 145; 25.455% identity (43.182% similar) in 220 aa overlap (469-668:239-437) 440 450 460 470 480 490 FLJ000 REAASWDFPEERTPERAQGGSFRSLRSWLISEGYATGPDDISPDWSPEQC-PPEPMEPAS ....:. : : .:.. :.:. :. KIAA09 MAYDKELRPDNRLSQSVYHGASSEGSLSPDTRSHASDVTDYSYPATPNHSLHPQPVTPSY 210 220 230 240 250 260 500 510 520 530 540 550 FLJ000 -----PAPTPTSLRAPRTQRTPGRSPA-AAIEEPWGREGPALLLLSRFSQAPDPSGALVT : :.: : . : :. : :...: : :::. : : . KIAA09 AAGDVPPHGPASQAAEHEYRPPSASARHMALNRPQQPPPPPP------PQAPEGSQASAP 270 280 290 300 310 320 560 570 580 590 600 FLJ000 -GPALYGLLT-----YV--TGAPGPPSPRALRILSRLTCNPACLEAFVRSYGAALLRAWL .:: ::.: : .: : :: : .. :. ::: . . KIAA09 MAPADYGMLPAQIIEYYNPSGPPPPPPPPVI---------PSAQTAFVSPLQMPMQPPF- 330 340 350 360 370 610 620 630 640 650 FLJ000 VLGVAPDDWPAPRARPTLHSRHRELGEFPYPPVSLPPCESPSSPMASMGPEP-HLP---- : . . .: : : : :: :: .: .: .:.. : : : KIAA09 -----PASASSTHAAPPHPPSTGLLVTAPPPPGPPPPPPGPPGPGSSLSSSPMHGPPVAE 380 390 400 410 420 660 670 680 690 700 710 FLJ000 THLSSPARPPDNLSPEWGGEQGVPVPPWAHRQSSAVSSALALGPRYPNSRCSPAPRIWAG .. . ::.:: KIAA09 AKRQEPAQPPISDARSDLLAAIRMGIQLKKVQEQREQEAKREPVGNDVATILSRRIAVEY 430 440 450 460 470 480 >>KIAA1249 ( 949 res) hh04184 (949 aa) initn: 133 init1: 60 opt: 145 Z-score: 94.0 bits: 28.4 E(): 4.9 Smith-Waterman score: 145; 25.591% identity (43.701% similar) in 254 aa overlap (446-685:573-802) 420 430 440 450 460 470 FLJ000 ALGLVPLLAGQLCGEAGEEEEEGREAASWDFPEERTPERAQGGSFRSLRSWLISEGYATG .: ::. : :. .. . .. .:. 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