# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00017.fasta.huge -Q ../query/FLJ00017.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00017, 291 aa vs ./tmplib.10216 library 2210703 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.7736+/-0.00387; mu= 12.7228+/- 0.260 mean_var=87.8716+/-20.230, 0's: 0 Z-trim: 6 B-trim: 161 in 1/39 Lambda= 0.136820 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 36, opt: 24, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA0763 ( 843 res) hk04726 ( 843) 485 105.6 9.7e-24 KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555) 467 102.4 1.7e-22 KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) ( 740) 456 99.8 4.7e-22 KIAA0248 ( 1880 res) ha02775s1 (1880) 440 97.1 7.7e-21 KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091) 300 69.2 1.1e-12 KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 ( 537) 292 67.3 2.1e-12 KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070) 92 28.2 2.6 KIAA0840 ( 523 res) hk04921s1 ( 523) 87 26.8 3.2 KIAA0643 ( 403 res) hj03545 ( 403) 83 25.9 4.6 KIAA0684 ( 1218 res) hk07567 (1218) 88 27.4 4.8 KIAA0442 ( 1266 res) hh03913 (1266) 88 27.5 4.9 KIAA1187 ( 813 res) fk03027 ( 813) 85 26.6 5.6 KIAA1128 ( 588 res) hg03213 ( 588) 83 26.1 5.9 FLJ00279 ( 563 res) sh01691 ( 563) 82 25.9 6.6 KIAA0061 ( 903 res) ha01242 ( 903) 83 26.3 7.8 FLJ00420 ( 613 res) sj09535 ( 613) 80 25.5 9.2 KIAA1643 ( 993 res) hh10131(revised) ( 993) 82 26.1 9.6 FLJ00231 ( 354 res) sj06637 ( 354) 77 24.6 9.7 KIAA0691 ( 762 res) hk03735 ( 762) 80 25.6 11 KIAA0719 ( 624 res) hk01141 ( 624) 79 25.3 11 KIAA0801 ( 1058 res) hg03949(revised) (1058) 81 26.0 11 KIAA1691 ( 558 res) fj00597s1 ( 558) 77 24.9 13 KIAA1786 ( 400 res) fh19009 ( 400) 75 24.3 14 KIAA0730 ( 1004 res) hk03632 (1004) 79 25.6 15 KIAA1507 ( 872 res) hk04967 ( 872) 78 25.3 15 FLJ00419 ( 229 res) sj09483 ( 229) 71 23.2 17 KIAA2015 ( 996 res) fk09763 ( 996) 78 25.4 17 KIAA0531 ( 999 res) hg03072 ( 999) 78 25.4 17 KIAA0674 ( 1234 res) hk02519 (1234) 79 25.7 17 KIAA1485 ( 1104 res) fj07037 (1104) 78 25.4 18 KIAA1569 ( 1140 res) fh22407 (1140) 78 25.4 18 KIAA0142 ( 802 res) ha01169 ( 802) 76 24.9 19 KIAA0845 ( 1034 res) hk05234s1 (1034) 76 25.0 22 KIAA1014 ( 1050 res) hk02388s2 (1050) 76 25.0 23 KIAA1606 ( 1095 res) fj10873 (1095) 76 25.0 23 FLJ00145 ( 1731 res) sh04908 (1731) 78 25.6 24 KIAA0138 ( 962 res) ha03743 ( 962) 75 24.7 24 KIAA0479 ( 340 res) hh00797 ( 340) 70 23.2 25 KIAA0287 ( 1523 res) fg06332 (1523) 77 25.4 25 KIAA1013 ( 1062 res) hj06791(revised) (1062) 75 24.8 26 KIAA1145 ( 467 res) hk10430 ( 467) 71 23.6 26 KIAA0772 ( 469 res) hk05119 ( 469) 71 23.6 26 FLJ00155 ( 612 res) sh06465 ( 612) 72 23.9 27 KIAA1230 ( 932 res) fh06860s1 ( 932) 74 24.5 27 FLJ00308 ( 233 res) sh05935 ( 233) 67 22.5 29 KIAA0053 ( 666 res) ha01417 ( 666) 72 24.0 29 KIAA0546 ( 1919 res) ef04555 (1919) 77 25.5 29 KIAA1180 ( 360 res) hf00665as1 ( 360) 69 23.1 29 KIAA1671 ( 364 res) hh02164 ( 364) 69 23.1 29 KIAA0589 ( 687 res) hj02695 ( 687) 72 24.0 29 >>KIAA0763 ( 843 res) hk04726 (843 aa) initn: 441 init1: 208 opt: 485 Z-score: 519.5 bits: 105.6 E(): 9.7e-24 Smith-Waterman score: 485; 37.037% identity (72.222% similar) in 216 aa overlap (61-269:391-603) 40 50 60 70 80 90 FLJ000 ELQRIKWHRKQLLEDIQKLKDEIADVFAQIDCFESAEESRMAQKEKELCIGRKKFNMDPA . ..: : . .... :: . :: : KIAA07 DTINCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRIGLNLFNKKPE 370 380 390 400 410 420 100 110 120 130 140 FLJ000 KGIQYFIEHKLLTPDVQ-DIARFLYKGEGLNKTAIGTYLGERDP-INLQVLQAFVDCHEF ::.::.:: . ..::. .:.:: . .::.. :: .::.:. .: .::. :: .: KIAA07 KGVQYLIE-RGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDF 430 440 450 460 470 150 160 170 180 190 200 FLJ000 ANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPGV---FQSTDTCYVLSFSI ....: .:::.: .:. :::::..:..:::. :::.::::: :.. :: ..:.:.: KIAA07 STMELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAI 480 490 500 510 520 530 210 220 230 240 250 260 FLJ000 IMLNTSLHNPNVRD--RPPFERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRVTWECSQRRSRERTFQKE :.:::....:::. . .: :.. ::...: :.:...: .: . :.:: ... KIAA07 ILLNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYE--RIRKRELKTNED 540 550 560 570 580 590 270 280 290 FLJ000 EVARTEACPDWERRGVQCGREPLRQHQE .:.... KIAA07 HVSQVQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQRE 600 610 620 630 640 650 >>KIAA0522 ( 1555 res) hg01393 (1555 aa) initn: 447 init1: 195 opt: 467 Z-score: 497.2 bits: 102.4 E(): 1.7e-22 Smith-Waterman score: 467; 38.028% identity (70.892% similar) in 213 aa overlap (80-286:826-1031) 50 60 70 80 90 100 FLJ000 KDEIADVFAQIDCFESAEESRMAQKEKELCIGRKKFNMDPAKGIQYFIEHKLLTPDVQDI :: . :: : :::::.::. .:. . KIAA05 LCKQTYQRETRHSWDSPAFNNDVVQRRHYRIGLNLFNKKPEKGIQYLIERGFLSDTPVGV 800 810 820 830 840 850 110 120 130 140 150 160 FLJ000 ARFLYKGEGLNKTAIGTYLGERDP-INLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPG :.:. . .::.. :: .::.:. .: .::. :: .:....: .:::.: .:. : KIAA05 AHFILERKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMDLDDALRKFQSHIRVQG 860 870 880 890 900 910 170 180 190 200 210 220 FLJ000 EAQKIDRMMEAFATRYCLCNPGV---FQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVR-DRP-PF ::::..:..:::. :::.:::.. :.. :: ..:.:.::.:::....:.:. .: . KIAA05 EAQKVERLIEAFSQRYCVCNPALVRQFRNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPSVKAERKMKL 920 930 940 950 960 970 230 240 250 260 270 280 FLJ000 ERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRVTWECSQRRSRERTFQKEEVARTEACPDWERRGVQCGR . :.. ::..:: :.:.: : .. : .:: . ..:....: :: : :. KIAA05 DDFIKNLRGVDNGEDIPRDLLVGIYQRIQ--GRELRTNDDHVSQVQAV---ERMIV--GK 980 990 1000 1010 1020 290 FLJ000 EPLRQHQE .:. KIAA05 KPVLSLPHRRLVCCCQLYEVPDPNRPQRLGLHQREVFLFNDLLVVTKIFQKKKILVTYSF 1030 1040 1050 1060 1070 1080 >>KIAA1110 ( 740 res) hh04831b(revised) (740 aa) initn: 392 init1: 201 opt: 456 Z-score: 489.2 bits: 99.8 E(): 4.7e-22 Smith-Waterman score: 456; 39.560% identity (73.626% similar) in 182 aa overlap (80-254:215-395) 50 60 70 80 90 100 FLJ000 KDEIADVFAQIDCFESAEESRMAQKEKELCIGRKKFNMDPAKGIQYFIEHKLLTPDVQ-D :: . ::..: ::::..: . .. ::. KIAA11 LSLPRYHCENPASCKSPTLSTDTLRKRLYRIGLNLFNINPDKGIQFLISRGFI-PDTPIG 190 200 210 220 230 240 110 120 130 140 150 160 FLJ000 IARFLYKGEGLNKTAIGTYLGE-RDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLP .:.:: . .::.. :: .::. . .: .::. :: .:....: .:::.: .:. KIAA11 VAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNSKKQFNRDVLDCVVDEMDFSSMELDEALRKFQAHIRVQ 250 260 270 280 290 300 170 180 190 200 210 220 FLJ000 GEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPGV---FQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVR-DRPP- :::::..:..:::. :::.::: : :.. :: ..:.:.::.:::....::.. :: KIAA11 GEAQKVERLIEAFSQRYCMCNPEVVQQFHNPDTIFILAFAIILLNTDMYSPNIKPDRKMM 310 320 330 340 350 360 230 240 250 260 270 280 FLJ000 FERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRVTWECSQRRSRERTFQKEEVARTEACPDWERRGVQCG .: :. ::...:.:.:.. . .: :.. KIAA11 LEDFIRNLRGVDDGADIPRELVVGIYERIQQKELKSNEDHVTYVTKVEKSIVGMKTVLSV 370 380 390 400 410 420 290 FLJ000 REPLRQHQE KIAA11 PHRRLVCCSRLFEVTDVNKLQKQAAHQREVFLFNDLLVILKLCPKKKSSSTYTFCKSVGL 430 440 450 460 470 480 >>KIAA0248 ( 1880 res) ha02775s1 (1880 aa) initn: 327 init1: 327 opt: 440 Z-score: 467.4 bits: 97.1 E(): 7.7e-21 Smith-Waterman score: 440; 38.356% identity (67.123% similar) in 219 aa overlap (38-244:677-893) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 FPRGVGMDLCHPEPAELSSGETEELQRIKWHRKQLLEDIQKLKDEIADV-FAQ----IDC : :. :... : :: ::. ..: KIAA02 ERTASDGKAVGMASDIPGLHLPGGGRLPPEHGKSGCSDLEEAVDSGADKKFARKPPRFSC 650 660 670 680 690 700 70 80 90 100 110 FLJ000 F--ESAEESRMAQKEKELCIGRKKFNMDPAKGIQYFIEHKLLT-P-DVQDIARFLYKGEG . . : .. .:.: : : ..::. : ::::.. :. ::: : : ..:..: .. KIAA02 LLPDPRELIEIKNKKKLLITGTEQFNQKPKKGIQFLQEKGLLTIPMDNTEVAQWLRENPR 710 720 730 740 750 760 120 130 140 150 160 170 FLJ000 LNKTAIGTYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMME :.: :: ....: :.: :..::. : .: : .::: .: .::::::: :.:..: KIAA02 LDKKMIGEFVSDRKNIDL--LESFVSTFSFQGLRLDEALRLYLEAFRLPGEAPVIQRLLE 770 780 790 800 810 820 180 190 200 210 220 230 FLJ000 AFATRYCLCNPGVFQSTDTCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDR-PP--FERFVSMNRGINN ::. :. :: . : ..:.:. :....:::::. :: ::: . : .:.: . .:.:. KIAA02 AFTERWMNCNGSPFANSDACFSLAYAVIMLNTDQHNHNVRKQNAPMTLEEFRKNLKGVNG 830 840 850 860 870 880 240 250 260 270 280 290 FLJ000 GSDLPEDQLRVTWECSQRRSRERTFQKEEVARTEACPDWERRGVQCGREPLRQHQE :.:. .: : KIAA02 GKDFEQDILEDMYHAIKNEEIVMPEEQTGLVRENYVWNVLLHRGATPEGIFLRVPTASYD 890 900 910 920 930 940 >>KIAA2011 ( 1091 res) pj02017 (1091 aa) initn: 288 init1: 288 opt: 300 Z-score: 320.8 bits: 69.2 E(): 1.1e-12 Smith-Waterman score: 300; 29.630% identity (67.284% similar) in 162 aa overlap (107-268:626-787) 80 90 100 110 120 130 FLJ000 ELCIGRKKFNMDPAKGIQYFIEHKLLTPDVQDIARFLYKGEGLNKTAIGTYLGERDPINL : .:. ::. .:. :. .. .::. . .. KIAA20 SDSELDSTERLALGSTDTLSNGQKADLEAAQRLAKRLYRLDGFRKADVARHLGKNNDFSK 600 610 620 630 640 650 140 150 160 170 180 190 FLJ000 QVLQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPGVFQSTD : .. :....: :::: :: . : ::.:. .:.. :. :: ::: ...: : KIAA20 LVAGEYLKFFVFTGMTLDQALRVFLKELALMGETQERERVLAHFSQRYFQCNPEALSSED 660 670 680 690 700 710 200 210 220 230 240 250 FLJ000 TCYVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRVTWECSQRRSR ..:. ....:::.::. :. : :.. .:.:.:.:.:.. :.. . . .. KIAA20 GAHTLTCALMLLNTDLHGHNIGKRMTCGDFIGNLEGLNDGGDFPRELLKALYSSIKNEKL 720 730 740 750 760 770 260 270 280 290 FLJ000 ERTFQKEEVARTEACPDWERRGVQCGREPLRQHQE . ....::. :. KIAA20 QWAIDEEELRRSLSELADPNPKVIKRISGGSGSGSSPFLDLTPEPGAAVYKHGALVRKVH 780 790 800 810 820 830 >>KIAA0942 ( 537 res) hh04979s1 (537 aa) initn: 313 init1: 284 opt: 292 Z-score: 315.9 bits: 67.3 E(): 2.1e-12 Smith-Waterman score: 292; 26.786% identity (66.071% similar) in 168 aa overlap (109-276:78-245) 80 90 100 110 120 130 FLJ000 CIGRKKFNMDPAKGIQYFIEHKLLTPDVQDIARFLYKGEGLNKTAIGTYLGERDPINLQV .:. ::. . .... .. .::. . .. : KIAA09 SEMGSTEILEKETPENLSNGTSSNVEAAKRLAKRLYQLDRFKRSDVAKHLGKNNEFSKLV 50 60 70 80 90 100 140 150 160 170 180 190 FLJ000 LQAFVDCHEFANLNLVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPGVFQSTDTC . .. .:....: :.:: :. .: : ::.:. .:.. :..:: ::: .. : : KIAA09 AEEYLKFFDFTGMTLDQSLRYFFKAFSLVGETQERERVLIHFSNRYFYCNPDTIASQDGV 110 120 130 140 150 160 200 210 220 230 240 250 FLJ000 YVLSFSIIMLNTSLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRVTWECSQRRSRER . :. .:..:::.::. :. . ..:.. .:.:.: :. .: :.. .. . .. : KIAA09 HCLTCAIMLLNTDLHGHNIGKKMTCQEFIANLQGVNEGVDFSKDLLKALYNSIKNEKLEW 170 180 190 200 210 220 260 270 280 290 FLJ000 TFQKEEVARTEACPDWERRGVQCGREPLRQHQE . . :: .. . :. KIAA09 AVDDEEKKKSPSESTEEKANGTHPKTISRIGSTTNPFLDIPHDPNAAVYKSGFLARKIHA 230 240 250 260 270 280 >>KIAA1862 ( 1070 res) aj00563 (1070 aa) initn: 44 init1: 44 opt: 92 Z-score: 99.0 bits: 28.2 E(): 2.6 Smith-Waterman score: 92; 29.630% identity (54.630% similar) in 108 aa overlap (189-287:503-604) 160 170 180 190 200 210 FLJ000 QFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPGVFQSTDTC-YVLSFSIIMLNTSLHNPNV : :.:... . :.:. . : . : :. 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