# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00015.fasta.huge -Q ../query/FLJ00015.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00015, 307 aa vs ./tmplib.10216 library 2210687 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 3.3285+/-0.00337; mu= 18.9341+/- 0.228 mean_var=63.8377+/-13.811, 0's: 0 Z-trim: 13 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.160522 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) FLJ00046 ( 169 res) as00046 ( 169) 1106 264.3 3.5e-72 KIAA0768 ( 872 res) hk05006 ( 872) 679 166.5 5e-42 KIAA0786 ( 1021 res) hk05490 (1021) 678 166.4 6.3e-42 KIAA0821 ( 1566 res) hh02631 (1566) 666 163.9 5.5e-41 KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364) 429 108.9 1.7e-24 KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854) 362 93.9 1.2e-19 KIAA0550 ( 1524 res) hh15909 (1524) 302 79.6 1.3e-15 KIAA0758 ( 1370 res) hh15259 (1370) 284 75.3 2.2e-14 KIAA0686 ( 1200 res) fj02322 (1200) 216 59.5 1.1e-09 KIAA1531 ( 1206 res) ph00937 (1206) 204 56.7 7.7e-09 FLJ00170 ( 1310 res) sh07968 (1310) 204 56.8 8e-09 FLJ00270 ( 352 res) sj07613 ( 352) 156 44.8 8.8e-06 KIAA1828 ( 496 res) ha06249 ( 496) 122 37.1 0.0025 KIAA1613 ( 686 res) fj12845 ( 686) 88 29.5 0.69 KIAA1910 ( 760 res) fh21867 ( 760) 85 28.9 1.2 KIAA0690 ( 1214 res) hk03594 (1214) 83 28.7 2.1 FLJ00234 ( 163 res) sj06933 ( 163) 75 25.5 2.6 FLJ00038 ( 199 res) as00038 ( 199) 72 24.9 4.7 FLJ00178 ( 249 res) sj01102 ( 249) 72 25.1 5.3 KIAA0225 ( 2013 res) ha02515 (2013) 78 27.9 6.1 KIAA0880 ( 727 res) hk07457 ( 727) 74 26.3 6.8 KIAA1607 ( 1270 res) fj11118 (1270) 74 26.6 9.1 KIAA1368 ( 1049 res) fj03125 (1049) 73 26.3 9.7 KIAA0564 ( 1441 res) hh01811 (1441) 74 26.7 9.7 KIAA0001 ( 347 res) ha00008 ( 347) 69 24.6 10 KIAA1348 ( 545 res) fj00937 ( 545) 70 25.2 11 KIAA0210 ( 801 res) ha02313 ( 801) 71 25.6 12 KIAA0301 ( 3210 res) hf00402s1 (3210) 75 27.5 13 KIAA0584 ( 738 res) hj00933 ( 738) 70 25.4 13 FLJ00297 ( 141 res) sh04004 ( 141) 64 22.9 14 FLJ00400 ( 782 res) sj07486 ( 782) 69 25.2 16 KIAA1730 ( 787 res) pg01135 ( 787) 69 25.2 16 KIAA0739 ( 1130 res) hk03925 (1130) 70 25.6 16 KIAA0937 ( 653 res) hh04715 ( 653) 68 24.8 17 KIAA1103 ( 453 res) hk10190 ( 453) 66 24.1 19 KIAA1539 ( 543 res) fg02356 ( 543) 66 24.2 21 KIAA1746 ( 1098 res) pj01729 (1098) 68 25.2 22 KIAA1260 ( 817 res) hh15752 ( 817) 67 24.7 22 KIAA1352 ( 1212 res) fj01313 (1212) 68 25.2 23 FLJ00396 ( 172 res) sj06426 ( 172) 61 22.3 25 KIAA1493 ( 415 res) fj08657 ( 415) 63 23.4 29 FLJ00232 ( 318 res) sj06640 ( 318) 62 22.9 30 FLJ00258 ( 792 res) sj09927 ( 792) 65 24.2 30 KIAA0662 ( 1114 res) hk01953s1 (1114) 66 24.7 30 KIAA1766 ( 1123 res) fj16085(revised) (1123) 66 24.7 31 FLJ00078 ( 103 res) as00078 ( 103) 58 21.3 31 KIAA0766 ( 640 res) hk04860 ( 640) 64 23.9 31 KIAA1797 ( 1281 res) fj20494 (1281) 66 24.8 33 KIAA0805 ( 1327 res) hk02940s1 (1327) 66 24.8 33 KIAA1429 ( 1795 res) fh08353 (1795) 67 25.3 33 >>FLJ00046 ( 169 res) as00046 (169 aa) initn: 1106 init1: 1106 opt: 1106 Z-score: 1389.2 bits: 264.3 E(): 3.5e-72 Smith-Waterman score: 1106; 99.408% identity (99.408% similar) in 169 aa overlap (139-307:1-169) 110 120 130 140 150 160 FLJ000 FLTARNLTVVNYSSINRFMKKLMFPVGYGVPAVTVAISAASRPHLYGTPSRCWLQPEKGF :::::::::: ::::::::::::::::::: FLJ000 PAVTVAISAAFRPHLYGTPSRCWLQPEKGF 10 20 30 170 180 190 200 210 220 FLJ000 IWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLAFKATAQLFILGCT :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ000 IWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLAFKATAQLFILGCT 40 50 60 70 80 90 230 240 250 260 270 280 FLJ000 WCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGKWSKGIRKLKTESE :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: FLJ000 WCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGKWSKGIRKLKTESE 100 110 120 130 140 150 290 300 FLJ000 MHTLSSSAKADTSKPSTVN ::::::::::::::::::: FLJ000 MHTLSSSAKADTSKPSTVN 160 >>KIAA0768 ( 872 res) hk05006 (872 aa) initn: 673 init1: 422 opt: 679 Z-score: 847.9 bits: 166.5 E(): 5e-42 Smith-Waterman score: 679; 38.519% identity (74.074% similar) in 270 aa overlap (6-275:278-539) 10 20 30 FLJ000 CSSTGIRHRNLVTQEEDPVLTVITYMGLSVSLLCL ..: . : .: .: :::..:. .::.:: KIAA07 GCRLLTTNKTHTTCSCNHLTNFAVLMAHVEVKHSDAV---HDLLLDVITWVGILLSLVCL 250 260 270 280 290 300 40 50 60 70 80 90 FLJ000 LLAALTFLLCKAIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVAIDQTGHKVLCSIIAGTLHYLYL :. .:: . ...:. ...: .: . ::.:.::::..:..: . . :...:. ::...: KIAA07 LICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCISLFVAELLFLIGINRTDQPIACAVFAALLHFFFL 310 320 330 340 350 360 100 110 120 130 140 150 FLJ000 ATLTWMLLEALYLFLTARNLTVVNYSSINRFMKKLMFPVGYGVPAVTVAISAASRPHLYG :..:::.::.. :.. :. : : .: .: .. ::::.::. ::.::: . :: KIAA07 AAFTWMFLEGVQLYIM---LVEVFESEHSR--RKYFYLVGYGMPALIVAVSAAVDYRSYG 370 380 390 400 410 160 170 180 190 200 210 FLJ000 TPSRCWLQPEKGFIWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLA : . :::. . :::.:.::. :. .:.... ..:. . .. . :. : . : : . . KIAA07 TDKVCWLRLDTYFIWSFIGPATLIIMLNVIFLGIALYKMFHHTAILKPESGCLDNIKSWV 420 430 440 450 460 470 220 230 240 250 260 270 FLJ000 FKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGK . : : : .:: :: .:.. .. .. .:::::::.:::::.:::. .:.:...::..::: KIAA07 IGAIALLCLLGLTWAFGLMYINESTVIMAYLFTIFNSLQGMFIFIFHCVLQKKVRKEYGK 480 490 500 510 520 530 280 290 300 FLJ000 WSKGIRKLKTESEMHTLSSSAKADTSKPSTVN KIAA07 CLRTHCCSGKSTESSIGSGKTSGSRTPGRYSTGSQSRIRRMWNDTVRKQSESSFITGDIN 540 550 560 570 580 590 >>KIAA0786 ( 1021 res) hk05490 (1021 aa) initn: 669 init1: 407 opt: 678 Z-score: 846.0 bits: 166.4 E(): 6.3e-42 Smith-Waterman score: 678; 38.742% identity (71.523% similar) in 302 aa overlap (8-304:395-687) 10 20 30 FLJ000 CSSTGIRHRNLVTQE--EDPVLTVITYMGLSVSLLCL ::... .. .. .:::::..:. .::.:: KIAA07 STQGCKLVDTNKTRTTCACSHLTNFAILMAHREIAYKDGVHELLLTVITWVGIVISLVCL 370 380 390 400 410 420 40 50 60 70 80 90 FLJ000 LLAALTFLLCKAIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVAIDQTGHKVLCSIIAGTLHYLYL . .:: . ...:. ...: .: . ::.:...::..::.: . . : :.:: ::...: KIAA07 AICIFTFCFFRGLQSDRNTIHKNLCINLFIAEFIFLIGIDKTKYAIACPIFAGLLHFFFL 430 440 450 460 470 480 100 110 120 130 140 150 FLJ000 ATLTWMLLEALYLFLTARNLTVVNYSSINRFMKKLMFPVGYGVPAVTVAISAASRPHLYG :...:: ::.. :.: :. : : .: :: .. .:: ::..:..::: . :: KIAA07 AAFAWMCLEGVQLYLM---LVEVFESEYSR--KKYYYVAGYLFPATVVGVSAAIDYKSYG 490 500 510 520 530 160 170 180 190 200 210 FLJ000 TPSRCWLQPEKGFIWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLA : . :::. .. :::.:.::: :. .:......:: . .. ..:. . : :.: . . KIAA07 TEKACWLHVDNYFIWSFIGPVTFIILLNIIFLVITLCKMVKHSNTLKPDSSRLENIKSWV 540 550 560 570 580 590 220 230 240 250 260 270 FLJ000 FKATAQLFILGCTWCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGK . : : : .:: :: .:.: .. . ::::::::.:..::::::. .: :...::..::: KIAA07 LGAFALLCLLGLTWSFGLLFINEETIVMAYLFTIFNAFQGVFIFIFHCALQKKVRKEYGK 600 610 620 630 640 650 280 290 300 FLJ000 ---WSKGIRKLKTESEMHTLSSSAKADTSKPSTVN : : ::: : ::.::.:.. : KIAA07 CFRHSYCCGGLPTESP-H---SSVKASTTRTSARYSSGTQSRIRRMWNDTVRKQSESSFI 660 670 680 690 700 710 KIAA07 SGDINSTSTLNQGMTGNYLLTNPLLRPHGTNNPYNTLLAETVVCNAPSAPVFNSPGHSLN 720 730 740 750 760 770 >>KIAA0821 ( 1566 res) hh02631 (1566 aa) initn: 664 init1: 399 opt: 666 Z-score: 829.2 bits: 163.9 E(): 5.5e-41 Smith-Waterman score: 666; 40.892% identity (71.747% similar) in 269 aa overlap (8-275:939-1202) 10 20 30 FLJ000 CSSTGIRHRNLVTQE-EDPVLTVITYMGLSVSLLCLL ::.. . .. .:.:::..:. .::.:: KIAA08 STQGCRLVESNKTHTTCACSHLTNFAVLMAHREIYQGRINELLLSVITWVGIVISLVCLA 910 920 930 940 950 960 40 50 60 70 80 90 FLJ000 LAALTFLLCKAIQNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVAIDQTGHKVLCSIIAGTLHYLYLA . :: . ...:. ...: .: . ::::.:::::.::.: ... : :.:: :::..:: KIAA08 ICISTFCFLRGLQTDRNTIHKNLCINLFLAELLFLVGIDKTQYEIACPIFAGLLHYFFLA 970 980 990 1000 1010 1020 100 110 120 130 140 150 FLJ000 TLTWMLLEALYLFLTARNLTVVNYSSINRFMKKLMFPVGYGVPAVTVAISAASRPHLYGT ...:. ::...:.: :. : : .: : .. :: ::..:.:.:: . ::: KIAA08 AFSWLCLEGVHLYLL---LVEVFESEYSR--TKYYYLGGYCFPALVVGIAAAIDYRSYGT 1030 1040 1050 1060 1070 1080 160 170 180 190 200 210 FLJ000 PSRCWLQPEKGFIWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLAF . :::. .. :::.:.::: .. ::::...::: . : :. . : : : . :. KIAA08 EKACWLRVDNYFIWSFIGPVSFVIVVNLVFLMVTLHKMIRSSSVLKPDSSRLDNIKSWAL 1090 1100 1110 1120 1130 1140 220 230 240 250 260 270 FLJ000 KATAQLFILGCTWCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGKW : : ::.:: :: .:.: .. . ::::::: .:..::::::. .: :...:...:.: KIAA08 GAIALLFLLGLTWAFGLLFINKESVVMAYLFTTFNAFQGVFIFVFHCALQKKVHKEYSKC 1150 1160 1170 1180 1190 1200 280 290 300 FLJ000 SKGIRKLKTESEMHTLSSSAKADTSKPSTVN KIAA08 LRHSYCCIRSPPGGTHGSLKTSAMRSNTRYYTGTQSRIRRMWNDTVRKQTESSFMAGDIN 1210 1220 1230 1240 1250 1260 >>KIAA0812 ( 1364 res) hg01044 (1364 aa) initn: 275 init1: 156 opt: 429 Z-score: 533.2 bits: 108.9 E(): 1.7e-24 Smith-Waterman score: 429; 28.063% identity (70.356% similar) in 253 aa overlap (19-270:590-831) 10 20 30 40 FLJ000 CSSTGIRHRNLVTQEEDPVLTVITYMGLSVSLLCLLLAALTFLLCKAI .:.:.:.. ..::. :.:.: .: ... KIAA08 SHARCRCSRTGTFGVLMDASPRERLEGDLELLAVFTHVVVAVSVAALVLTAAILLSLRSL 560 570 580 590 600 610 50 60 70 80 90 100 FLJ000 QNTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVAIDQTGHKVLCSIIAGTLHYLYLATLTWMLLEALYL ... ..: ... : .:.::::..: .: ....:. .: :::..:.:..:.....:.: KIAA08 KSNVRGIHANVAAALGVAELLFLLGIHRTHNQLVCTAVAILLHYFFLSTFAWLFVQGLHL 620 630 640 650 660 670 110 120 130 140 150 160 FLJ000 FLTARNLTVVNYSSINRFMKKLMFPVGYGVPAVTVAISAASRPHLYGTPSRCWLQPEKGF . :. ...: ... .:.::::: ...... :. ::.:. ::.. .. . KIAA08 YRMQ-----VEPRNVDRGAMRFYHALGWGVPAVLLGLAVGLDPEGYGNPDFCWISVHEPL 680 690 700 710 720 730 170 180 190 200 210 220 FLJ000 IWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLAFKATAQLFIL-GC ::.: ::: .. .: ..:: : : : ... . ..: :..... :..: . KIAA08 IWSFAGPVVLVIVMNGTMFL-----LAARTSCSTGQREA-KKTSALTLRSSFLLLLLVSA 740 750 760 770 780 230 240 250 260 270 280 FLJ000 TWCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGKWSKGIRKLKTES .: .:.: :. . .. :: . . .:::. ..:..:.:. ..: KIAA08 SWLFGLLAVNHSILAFHYLHAGLCGLQGLAVLLLFCVLNADARAAWMPACLGRKAAPEEA 790 800 810 820 830 840 290 300 FLJ000 EMHTLSSSAKADTSKPSTVN KIAA08 RPAPGLGPGAYNNTALFEESGLIRITLGASTVSSVSSARSGRTQDQDSQRGRSYLRDNVL 850 860 870 880 890 900 >>KIAA0279 ( 2854 res) ff05612 (2854 aa) initn: 455 init1: 214 opt: 362 Z-score: 446.2 bits: 93.9 E(): 1.2e-19 Smith-Waterman score: 478; 35.178% identity (68.379% similar) in 253 aa overlap (20-271:2307-2549) 10 20 30 40 FLJ000 CSSTGIRHRNLVTQEEDPVLTVITYMGLSVSLLCLLLAALTFLLCKAIQ : ..::..:.:.: :::. . . : . .. KIAA02 ESHVSCQCNHMTSFAVLMDVSRRENGEILPLKTLTYVALGVTLAALLLTFFFLTLLRILR 2280 2290 2300 2310 2320 2330 50 60 70 80 90 100 FLJ000 NTSTSLHLQLSLCLFLAHLLFLVAIDQTGHKVLCSIIAGTLHYLYLATLTWMLLEALYLF ... ... .:. : ::.:.::..:.:. :..:: ::.::: :..: :::::.:. KIAA02 SNQHGIRRNLTAALGLAQLVFLLGINQADLPFACTVIAILLHFLYLCTFSWALLEALHLY 2340 2350 2360 2370 2380 2390 110 120 130 140 150 160 FLJ000 LTARNLTVVNYSSINRFMKKLMFPVGYGVPAVTVAISAASRPHLYGTPSRCWLQPEKGFI : :: : ..: .... .:.:::: ...... :. ::.:. :::. .: KIAA02 ---RALTEVR--DVNTGPMRFYYMLGWGVPAFITGLAVGLDPEGYGNPDFCWLSIYDTLI 2400 2410 2420 2430 2440 2450 170 180 190 200 210 220 FLJ000 WGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSEVSTLRNTRMLAFKAT-AQLFILGCT :.: ::: :.:.. .:: .:: : : .. . .. . ... . : :..:. : KIAA02 WSFAGPV--AFAVSMSVFL---YILAARASCAAQRQGFEKKGPVSGLQPSFAVLLLLSAT 2460 2470 2480 2490 2500 230 240 250 260 270 280 FLJ000 WCLGILQVGPAARVMAYLFTIINSLQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGKWSKGIRKLKTESE : :..:.:. . .. :::. : .:: :::: : .::..::. 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KIAA05 SYMAVTGKIRT--------RLIRKRFLCLGWGLPALVVATSVGFTRTKGYGTDHYCWLSL 970 980 990 1000 1010 170 180 190 200 FLJ000 EKGFIWGFLGPVCAIFSVNLVLFLVTLWILKNRLSSLNSE-------------------- : :....:.::. :. ::.:. .... : .: . :... KIAA05 EGGLLYAFVGPAAAVVLVNMVIGILVFNKLVSRDGILDKKLKHRAGQMSEPHSGLTLKCA 1020 1030 1040 1050 1060 1070 210 220 230 240 250 FLJ000 ----VSTLRNTRMLAFKATAQLF-------ILGCTWCLGILQVGPAARVM-AYLFTIINS ::: . : .: :.:. .:. :: ..: . .. ::....: KIAA05 KCGVVSTTALSATTASNAMASLWSSCVVLPLLALTWMSAVLAMTDKRSILFQILFAVFDS 1080 1090 1100 1110 1120 1130 260 270 280 290 300 FLJ000 LQGVFIFLVYCLLSQQVREQYGKWSKGIRKLKTESEMHTLSSSAKADTSKPSTVN ::: : .:.:.: ..:.. . 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