# /usr/local/bin/fasta34_t -T 4 -b50 -d10 -H -O./tmp/as00006.fasta.huge -Q ../query/FLJ00006.ptfa ./tmplib.10216 2 FASTA searches a protein or DNA sequence data bank version 34.26.5 April 26, 2007 Please cite: W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448 FLJ00006, 401 aa vs ./tmplib.10216 library 2210593 residues in 2457 sequences Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.4080+/-0.00393; mu= 15.9169+/- 0.266 mean_var=85.8203+/-18.758, 0's: 0 Z-trim: 12 B-trim: 0 in 0/40 Lambda= 0.138446 FASTA (3.5 Sept 2006) function [optimized, BL50 matrix (15:-5)] ktup: 2 join: 37, opt: 25, open/ext: -10/-2, width: 16 The best scores are: opt bits E(2457) KIAA1055 ( 868 res) hh09512 ( 868) 651 140.1 5.6e-34 KIAA0882 ( 1291 res) hk07544s1 (1291) 583 126.8 8.7e-30 KIAA0676 ( 1262 res) hk02596 (1262) 554 121.0 4.8e-28 KIAA1108 ( 763 res) hh03387s1 ( 763) 399 89.7 7.3e-19 KIAA0603 ( 1348 res) hg01488b (1348) 397 89.6 1.4e-18 KIAA0019 ( 838 res) ha00537 ( 838) 353 80.6 4.5e-16 FLJ00288 ( 217 res) sh02579 ( 217) 344 78.0 6.9e-16 KIAA1322 ( 702 res) fh13826 ( 702) 283 66.5 6.6e-12 KIAA0608 ( 775 res) hh00889b ( 775) 270 64.0 4.2e-11 KIAA0984 ( 728 res) hj07670 ( 728) 160 42.0 0.00017 FLJ00332 ( 201 res) sj03652 ( 201) 130 35.2 0.0049 KIAA1941 ( 1233 res) ah04470 (1233) 115 33.3 0.12 KIAA0397 ( 1016 res) fj00010 (1016) 103 30.8 0.55 KIAA0665 ( 760 res) hk02064 ( 760) 99 29.8 0.8 KIAA1468 ( 985 res) fj01719 ( 985) 94 29.0 1.9 FLJ00175 ( 1516 res) sj00758 (1516) 95 29.4 2.1 FLJ00050 ( 270 res) as00050 ( 270) 79 25.2 6.8 FLJ00236 ( 702 res) sj07289 ( 702) 83 26.6 7 KIAA0014 ( 513 res) ha00442 ( 513) 81 26.0 7.6 KIAA0594 ( 1120 res) hj02896s1 (1120) 84 27.0 8.1 KIAA1545 ( 968 res) fj14026s1 ( 968) 83 26.7 8.5 KIAA1563 ( 1658 res) fh20460s1 (1658) 85 27.4 8.9 KIAA0950 ( 343 res) hj05289 ( 343) 77 25.0 10 KIAA1976 ( 351 res) fg02988 ( 351) 76 24.8 12 KIAA1803 ( 1412 res) fj22564s1 (1412) 82 26.8 12 KIAA1614 ( 1208 res) fj12973 (1208) 81 26.5 13 KIAA1724 ( 400 res) pf00943 ( 400) 76 24.8 13 KIAA0401 ( 344 res) hg01095 ( 344) 75 24.6 14 KIAA1660 ( 114 res) hg03328 ( 114) 69 22.7 16 FLJ00027 ( 260 res) as00027 ( 260) 72 23.8 17 KIAA1486 ( 677 res) fj07162 ( 677) 75 24.9 21 KIAA0983 ( 687 res) hj07256 ( 687) 75 25.0 21 KIAA0914 ( 678 res) sj01106 ( 678) 74 24.7 24 KIAA1716 ( 804 res) hj06603 ( 804) 74 24.8 26 KIAA0077 ( 1798 res) ha00919 (1798) 77 25.9 28 KIAA0057 ( 384 res) ha00909 ( 384) 70 23.6 29 KIAA1886 ( 655 res) fk01837 ( 655) 72 24.3 30 KIAA0929 ( 1663 res) hh03374 (1663) 76 25.7 31 KIAA0228 ( 681 res) ha04738 ( 681) 72 24.3 31 FLJ00001 ( 155 res) as00001 ( 155) 65 22.1 33 KIAA1087 ( 952 res) hk02378 ( 952) 73 24.7 33 KIAA1475 ( 986 res) fj03454 ( 986) 73 24.8 34 KIAA1190 ( 174 res) hg03443a ( 174) 65 22.2 36 KIAA0844 ( 438 res) hk05227 ( 438) 69 23.5 36 KIAA0280 ( 291 res) ha06179 ( 291) 67 22.9 37 KIAA0323 ( 724 res) hg00467 ( 724) 71 24.2 37 KIAA1248 ( 368 res) hh03309a ( 368) 68 23.2 37 FLJ00315 ( 925 res) sh06842 ( 925) 72 24.5 38 KIAA1684 ( 762 res) fh24594 ( 762) 71 24.2 38 KIAA1850 ( 1236 res) pf00747(revised) (1236) 73 24.9 39 >>KIAA1055 ( 868 res) hh09512 (868 aa) initn: 636 init1: 592 opt: 651 Z-score: 703.3 bits: 140.1 E(): 5.6e-34 Smith-Waterman score: 660; 38.406% identity (71.377% similar) in 276 aa overlap (25-291:577-852) 10 20 30 40 FLJ000 AWLQSAGELPSDGGCSTRLRWQAHLEFTHNHDVGD-LTWDK-IAVSLPR----S : .:.:..:. . :.. .: .. : : KIAA10 EYDIYGFRTVPEDDEEEKLVAKVRALDLKTLYLTENQEVSTGVKWENYFASTVNREMMCS 550 560 570 580 590 600 50 60 70 80 90 100 FLJ000 EKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKK--RNSELS-YREIVKNSSNDETIAAKQIEK .:..:. ::::: : ..: .: :.: . .. ..... . .. :.:::: KIAA10 PELKNLIRAGIPHEHRSKVWKWCVDRHTRKFKDNTEPGHFQTLLQKALEKQNPASKQIEL 610 620 630 640 650 660 110 120 130 140 150 160 FLJ000 DLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAF :::::.:.: .. : :. .:: :: :..: :.:::::: . ..: ::.::.:::: KIAA10 DLLRTLPNNKHYSCPTSEGIQKLRNVLLAFSWRNPDIGYCQGLNRLVAVALLYLEQEDAF 670 680 690 700 710 720 170 180 190 200 210 220 FLJ000 WMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWF : . .:.: ..: .:.. :::: :.::::.: :. . :::: .... .. .:::..:: KIAA10 WCLVTIVEVFMPRDYYTKTLLGSQVDQRVFRDLMSEKLPRLHGHFEQYKVDYTLITFNWF 730 740 750 760 770 780 230 240 250 260 270 280 FLJ000 LTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIP :..:.. : .:..::: :.::: .:.:...:.... ::::... ..: :::. : . KIAA10 LVVFVDSVVSDILFKIWDSFLYEGPKVIFRFALALFKYKEEEILKLQDSMSIFKYLRYFT 790 800 810 820 830 840 290 300 310 320 330 340 FLJ000 SQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVAQDGG . :: KIAA10 RTILDARSGTDAPTTWRKSGWS 850 860 >>KIAA0882 ( 1291 res) hk07544s1 (1291 aa) initn: 315 init1: 205 opt: 583 Z-score: 628.1 bits: 126.8 E(): 8.7e-30 Smith-Waterman score: 583; 36.226% identity (71.321% similar) in 265 aa overlap (43-307:525-785) 20 30 40 50 60 70 FLJ000 GGCSTRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLS . . :.:: : ::: :::..:: .::. :: KIAA08 RSPEEFNPKLAKEFLKEQAWKIHFAEYGQGICMYRTEKTRELVLKGIPESMRGELWLLLS 500 510 520 530 540 550 80 90 100 110 120 130 FLJ000 GALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVL ::...: . :...:..: . ..:...::.:: :..: . : .. .:. ::::: KIAA08 GAINEKATHPGYYEDLVEKSMGKYNLATEEIERDLHRSLPEHPAF--QNEMGIAALRRVL 560 570 580 590 600 610 140 150 160 170 180 190 FLJ000 RALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQ : :. :.:::::. ..:.. :::. .::.:::.. :. : .:: .:..: ..:. .:: KIAA08 TAYAFRNPNIGYCQAMNIVTSVLLLYAKEEEAFWLLVALCERMLP-DYYNTRVVGALVDQ 620 630 640 650 660 670 200 210 220 230 240 250 FLJ000 RVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRV :...: .:.:.: .:. . .: :.: :::: : ::. .. . . : ::::: .: KIAA08 GVFEELARDYVPQLYDCMQDLGV-ISTISLSWFLTLFLSVMPFESAVVVVDCFFYEGIKV 680 690 700 710 720 730 260 270 280 290 300 310 FLJ000 LFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVET .:::.:..: . ..:.. .... ...:. ... . . : .: . :.: KIAA08 IFQLALAVLDANVDKLLNCKDDGEAMTVLGRYLDSVTNKDSTLPPIPHLHSLLSDDVEPY 740 750 760 770 780 790 320 330 340 350 360 370 FLJ000 QRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVAQDGGPHLDPQHTGRRGHLEVQSTGAAENKPA KIAA08 PEVDIFRLIRTSYEKFGTIRADLIEQMRFKQRLKVIQTLEDTTKRNVVRTIVTETSFTID 800 810 820 830 840 850 >>KIAA0676 ( 1262 res) hk02596 (1262 aa) initn: 482 init1: 191 opt: 554 Z-score: 596.9 bits: 121.0 E(): 4.8e-28 Smith-Waterman score: 554; 39.207% identity (72.247% similar) in 227 aa overlap (43-269:505-727) 20 30 40 50 60 70 FLJ000 GGCSTRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLS : . :. : :.::: :::...: .::. .: KIAA06 SPMEDLGAKGAKEKMKEESWHIHFFEYGRGVCMYRTAKTRALVLKGIPESLRGELWLLFS 480 490 500 510 520 530 80 90 100 110 120 130 FLJ000 GALQKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVL :: .. . : :.:..:.. ..:...::.:: :.:: . : . .:. ::::: KIAA06 GAWNEMVTHPGYYAELVEKSTGKYSLATEEIERDLHRSMPEHPAFQN--ELGIAALRRVL 540 550 560 570 580 590 140 150 160 170 180 190 FLJ000 RALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPASYFSTTLLGVQTDQ : :. : :::::. ..:.. :::. ::.:::.. :. : .:: .:..: ..:. .:: KIAA06 TAYAFRNPTIGYCQAMNIVTSVLLLYGSEEEAFWLLVALCERMLP-DYYNTRVVGALVDQ 600 610 620 630 640 650 200 210 220 230 240 250 FLJ000 RVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRV ....: ..::.:.. .:. . .: :.: :::: : ::. .. . : : ::::: .: KIAA06 GIFEELTRDFLPQLSEKMQDLGV-ISSISLSWFLTLFLSVMPFESAVVIVDCFFYEGIKV 660 670 680 690 700 710 260 270 280 290 300 310 FLJ000 LFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAELLLGVAMRLAGSLTDVAVET ..:..:..: . :.:. KIAA06 ILQVALAVLDANMEQLLGCSDEGEAMTMLGRYLDNVVNKQSVSPPIPHLRALLSSSDDPP 720 730 740 750 760 770 >>KIAA1108 ( 763 res) hh03387s1 (763 aa) initn: 389 init1: 339 opt: 399 Z-score: 431.9 bits: 89.7 E(): 7.3e-19 Smith-Waterman score: 406; 30.000% identity (61.852% similar) in 270 aa overlap (38-289:369-634) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 ELPSDGGCSTRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRS------EKLRSLVLAGIPH :.:. . :: ::..: : :.:. KIAA11 LQASENDLLNKRLKLDYEEITPCLKEVTTVWEKMLSTPGRSKIKFDMEKMHSAVGQGVPR 340 350 360 370 380 390 70 80 90 100 110 FLJ000 GMRPQLWMRLSGALQ-------KKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPSN : ..: :. .. :.. ... :.:..:. .... . : :: ::.:.. KIAA11 HHRGEIWKFLAEQFHLKHQFPSKQQPKDVPYKELLKQLTSQQ----HAILIDLGRTFPTH 400 410 420 430 440 450 120 130 140 150 160 170 FLJ000 ACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIED :... . : : .:.: . : :.::::: ..::. ::: . ::.:: :.. .. : KIAA11 PYFSAQLGAGQLSLYNILKAYSLLDQEVGYCQGLSFVAGILLLHMSEEEAFKMLKFLMFD 460 470 480 490 500 510 180 190 200 210 220 230 FLJ000 LLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVVD . . . .. .: .. : .:. .: : . :.::.: :: . :::: ::: KIAA11 MGLRKQYRPDMIILQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEEHEIGPSLYAAPWFLTMFASQFP 520 530 540 550 560 570 240 250 260 270 280 FLJ000 IKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTL-SDIPS----QME . .. :..:..: .:..:.:...:..: .. ..: :: .: . . : .:. ::: KIAA11 LGFVARVFDMIFLQGTEVIFKVALSLLGSHKPLILQHENLETIVDFIKSTLPNLGLVQME 580 590 600 610 620 630 290 300 310 320 330 340 FLJ000 DAELLLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVAQDGGPHLD KIAA11 KTINQVFEMDIAKQLQAYEVEYHVLQEELIDSSPLSDNQRMDKLEKTNSSLRKQNLDLLE 640 650 660 670 680 690 >>KIAA0603 ( 1348 res) hg01488b (1348 aa) initn: 354 init1: 327 opt: 397 Z-score: 427.1 bits: 89.6 E(): 1.4e-18 Smith-Waterman score: 397; 29.259% identity (63.333% similar) in 270 aa overlap (36-293:941-1206) 10 20 30 40 50 60 FLJ000 AGELPSDGGCSTRLRWQAHLEFTHNHDVGDLTWDKIAVSLPRS-----EKLRSLVLAGIP .:::: .. . : ...:. :.: KIAA06 KLEGASRDELQSRKVKLDYEEVGACQKEVLITWDKKLLNCRAKIRCDMEDIHTLLKEGVP 920 930 940 950 960 970 70 80 90 100 110 FLJ000 HGMRPQLWM------RLSGAL-QKKRNSELSYREIVKNSSNDETIAAKQIEKDLLRTMPS .. : ..:. :: : .:.. ..::.:..:. . .. . : :: ::.:. KIAA06 KSRRGEIWQFLALQYRLRHRLPNKQQPPDISYKELLKQLTAQQ----HAILVDLGRTFPT 980 990 1000 1010 1020 120 130 140 150 160 170 FLJ000 NACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACLLLFLEEEDAFWMMSAIIE . :. . . : : .:.: . : :.::::: ..::. ::: . ::.:: :.. .. KIAA06 HPYFSVQLGPGQLSLFNLLKAYSLLDKEVGYCQGISFVAGVLLLHMSEEQAFEMLKFLMY 1030 1040 1050 1060 1070 1080 180 190 200 210 220 230 FLJ000 DLLPASYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEHDIELSLITLHWFLTAFASVV :: . . ....: .. : .:. .: : . :.:..: :: . :::: ::: KIAA06 DLGFRKQYRPDMMSLQIQMYQLSRLLHDYHRDLYNHLEENEISPSLYAAPWFLTLFASQF 1090 1100 1110 1120 1130 1140 240 250 260 270 280 290 FLJ000 DIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQSENSASIFNTLSDIPSQMEDAEL .. .. :..:..: .:..:.:...:..: .: ... :. .: . :.. .:. .:. KIAA06 SLGFVARVFDIIFLQGTEVIFKVALSLLSSQETLIMECESFENIVEFLKNTLPDMNTSEM 1150 1160 1170 1180 1190 1200 300 310 320 330 340 350 FLJ000 LLGVAMRLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQGQLLGAGTLTNLSQVAQDGGPHLDPQHT KIAA06 EKIITQVFEMDISKQLHAYEVEYHVLQDELQESSYSCEDSETLEKLERANSQLKRQNMDL 1210 1220 1230 1240 1250 1260 >>KIAA0019 ( 838 res) ha00537 (838 aa) initn: 321 init1: 162 opt: 353 Z-score: 381.8 bits: 80.6 E(): 4.5e-16 Smith-Waterman score: 356; 25.193% identity (54.499% similar) in 389 aa overlap (8-378:65-441) 10 20 30 FLJ000 AWLQSAGELPSDGGCSTRLRWQAHLEFTHNHDVGDLT :::. . : : :::. .. . KIAA00 GREGAEIEPWEDADYLVYKVTDRFGFLHEEELPDHNVAVER---QKHLEIERTTKWLKML 40 50 60 70 80 90 40 50 60 70 80 90 FLJ000 --WDKIAVSLPRSEKLRSLVLAGIPHGMRPQLWMRLSGALQKKRNSELSYREIVKNSSND :.: .::.. . ::: .: ..: : . :.... : .. :. . KIAA00 KGWEKYK----NTEKFHRRIYKGIPLQLRGEVWALLLEIPKMKEETRDLYSKL-KHRARG 100 110 120 130 140 100 110 120 130 140 150 FLJ000 ETIAAKQIEKDLLRTMPSNACFASMGSIGVPRLRRVLRALAWLYPEIGYCQGTGMVAACL . .::. :. ::. .. : . .. : .:: : . :.::::: ....: : KIAA00 CSPDIRQIDLDVNRTFRDHIMFRDRYGVKQQSLFHVLAAYSIYNTEVGYCQGMSQITALL 150 160 170 180 190 200 160 170 180 190 200 210 FLJ000 LLFLEEEDAFWMMSAIIEDLLPA--SYFSTTLLGVQTDQRVLRHLIVQYLPRLDKLLQEH :....:::::: . .. : ..: . . :. .... ..: .: . :. . KIAA00 LMYMNEEDAFWALVKLFSGPKHAMHGFFVQGFPKLLRFQEHHEKILNKFLSKLKQHLDSQ 210 220 230 240 250 260 220 230 240 250 260 270 FLJ000 DIELSLITLHWFLTAFASVVDIKLLLRIWDLFFYEGSRVLFQLTLGMLHLKEEELIQ--S .: :. :..::. : . . . : :::::....:: ::: .. .:.:....:.. KIAA00 EIYTSFYTMKWFFQCFLDRTPFTLNLRIWDIYIFEGERVLTAMSYTILKLHKKHLMKLSM 270 280 290 300 310 320 280 290 300 310 320 FLJ000 ENSASIFNTLSDIPSQMEDAELL--LGVAM----RLAGSLTDVAVETQRRKHLAYLIADQ :. . .:. .:: .. : ..: : .: . . : . :. . . 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