BLAST2 result
TBLASTN 2.2.2 [Dec-14-2001]
Reference: Altschul, Stephen F., Thomas L. Madden, Alejandro A. Schaffer,
Jinghui Zhang, Zheng Zhang, Webb Miller, and David J. Lipman (1997),
"Gapped BLAST and PSI-BLAST: a new generation of protein database search
programs", Nucleic Acids Res. 25:3389-3402.
Query= AC134322.4 - phase: 0 /pseudo
(1735 letters)
Database: LJGI
28,460 sequences; 14,692,800 total letters
Searching..................................................done
Score E
Sequences producing significant alignments: (bits) Value
TC18710 78 1e-14
CN825682 72 6e-13
AU251850 64 2e-10
AV768875 49 7e-06
BP030997 43 5e-04
TC17619 similar to UP|O48939 (O48939) Polyphosphoinositide bindi... 43 5e-04
TC18883 42 6e-04
TC13352 homologue to GB|AAO64817.1|29028876|BT005882 At3g04570 {... 41 0.002
BP056308 41 0.002
BP065348 40 0.002
BP065663 40 0.003
BP066973 39 0.007
BP084236 39 0.009
TC19778 similar to UP|Q9LNJ1 (Q9LNJ1) F6F3.12 protein, partial (5%) 39 0.009
TC11523 UP|Q7PHQ1 (Q7PHQ1) ENSANGP00000024044 (Fragment), partia... 38 0.012
TC11768 38 0.016
AV772980 37 0.027
BP065838 36 0.059
BP056651 36 0.059
TC15556 similar to UP|AAS51733 (AAS51733) ADL187Wp, partial (8%) 35 0.077
>TC18710
Length = 843
Score = 77.8 bits (190), Expect = 1e-14
Identities = 43/100 (43%), Positives = 64/100 (64%), Gaps = 1/100 (1%)
Frame = +2
Query: 1371 GKEKSVALKLDISKAYDRIDWAYLRDVMSKMGFSEK*I*WIMMWVGTVDYSVILNKEKIG 1430
G+ S+ +KLD++KAYDR++W +L + GFS + IM+ V V Y+ +N +G
Sbjct: 548 GRNHSI-IKLDMNKAYDRVEWKFLESSLLAFGFSTNWVKMIMILVSGVSYNYKINGV-VG 721
Query: 1431 P-IIPGFGLRQGDPLSPYLFILCAEGLSAQIRNAESRGDL 1469
P ++P GLRQGDP SPYLF+ E LS I+N+ + G+L
Sbjct: 722 PKLLPQRGLRQGDPFSPYLFLFTMEVLSLLIQNSFNMGNL 841
>CN825682
Length = 626
Score = 72.4 bits (176), Expect = 6e-13
Identities = 38/98 (38%), Positives = 52/98 (52%)
Frame = -3
Query: 716 NLPWCQMGDFNDILHSDEKKGRATRPNWLIRGFRHSIQDVGLIDVHMEGYLFTWFKSLGT 775
N W GDFN+ILH EK+G + I+ FR + L+D+ ++G FTW +L
Sbjct: 309 NTFWTCYGDFNEILHHQEKEGARDQDPTRIQVFRDFLDGANLMDLELKGCRFTWLSNLRN 130
Query: 776 TRVVEEKLDRALATNSWMQLFPNAKLENLVAPSSDHFP 813
V +E+LDR L +W +PNA L SSDH P
Sbjct: 129 GLVTKERLDRVLVNWTWRLDYPNATAMALPIISSDHSP 16
>AU251850
Length = 343
Score = 63.9 bits (154), Expect = 2e-10
Identities = 32/95 (33%), Positives = 52/95 (54%), Gaps = 4/95 (4%)
Frame = +2
Query: 585 PRPMSIIAWNCRGLGNLRVIPKIKFLVRYYKQDILFLCETMVEVNKIEEFRYLLGYDFCF 644
P M +++WNCRGLG+ R + ++ LVR ++FL ET ++ + E+ G C
Sbjct: 29 PTAMKLLSWNCRGLGSPRAVEALQRLVRKEIPQLVFLMETKLKKFETEKISLGFGLSNCL 208
Query: 645 ----APARNNRSGGIAYFWRNTVNCSIVNYSANHI 675
R GG+A +W +V+ S+V++S NHI
Sbjct: 209 IVDCVGDEKERKGGLAMWWNASVDVSLVSFSGNHI 313
>AV768875
Length = 232
Score = 48.9 bits (115), Expect = 7e-06
Identities = 24/67 (35%), Positives = 35/67 (51%)
Frame = +1
Query: 705 WNFIRGLARQINLPWCQMGDFNDILHSDEKKGRATRPNWLIRGFRHSIQDVGLIDVHMEG 764
W + + I++PW +GD N+IL + +G PN R F + D LID+ M G
Sbjct: 16 WQHLSTIRASISIPWLLIGDMNEILFPSQVRGGEFHPNRAQR-FATVLDDCNLIDLGMVG 192
Query: 765 YLFTWFK 771
FTWF+
Sbjct: 193 GKFTWFR 213
>BP030997
Length = 500
Score = 42.7 bits (99), Expect = 5e-04
Identities = 20/31 (64%), Positives = 23/31 (73%)
Frame = +1
Query: 942 LQFRGGN*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
+Q + G * + YIYIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 25 IQIQLGT*KYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI 117
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.003
Identities = 17/28 (60%), Positives = 19/28 (67%)
Frame = -1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIEY*DC 977
++ YIYIYIYIYIYIYIYI C
Sbjct: 116 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYFHVPSC 33
Score = 39.7 bits (91), Expect = 0.004
Identities = 17/20 (85%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = +3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
YIYIYIYIYIYIYIYI I +
Sbjct: 60 YIYIYIYIYIYIYIYIYIYF 119
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.009
Identities = 16/23 (69%), Positives = 18/23 (77%)
Frame = -2
Query: 947 GN*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIY 969
G ++ YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 121 GKYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIY 53
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 14/21 (66%), Positives = 18/21 (85%)
Frame = +1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
++ YIYIYIYIYIYIYI++
Sbjct: 61 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIFL 123
Score = 29.6 bits (65), Expect = 4.2
Identities = 10/25 (40%), Positives = 17/25 (68%)
Frame = -2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
++ YIYIYIYIY ++Y + + +
Sbjct: 94 IYIYIYIYIYIYIYTFMYQVVFVSF 20
>TC17619 similar to UP|O48939 (O48939) Polyphosphoinositide binding protein
Ssh1p, partial (32%)
Length = 612
Score = 42.7 bits (99), Expect = 5e-04
Identities = 21/25 (84%), Positives = 21/25 (84%), Gaps = 2/25 (8%)
Frame = +3
Query: 951 FTQY--YIYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
F QY YIYIYIYIYIYIYIYI IE
Sbjct: 369 FCQYCKYIYIYIYIYIYIYIYIYIE 443
Score = 42.0 bits (97), Expect = 8e-04
Identities = 17/20 (85%), Positives = 19/20 (95%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
YIYIYIYIYIYIYIYI ++Y
Sbjct: 436 YIYIYIYIYIYIYIYIYLQY 377
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.002
Identities = 17/19 (89%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -2
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
+YIYIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 443 FYIYIYIYIYIYIYIYIYI 387
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.016
Identities = 16/17 (94%), Positives = 16/17 (94%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIR 971
YIYIYIYIYIYIYIY R
Sbjct: 395 YIYIYIYIYIYIYIYRR 445
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/19 (78%), Positives = 16/19 (83%)
Frame = -1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYI 968
L+ YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 441 LYIYIYIYIYIYIYIYIYI 385
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.29
Identities = 13/18 (72%), Positives = 15/18 (83%)
Frame = +2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIY 967
++ YIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 386 IYIYIYIYIYIYIYIYIY 439
>TC18883
Length = 821
Score = 42.4 bits (98), Expect = 6e-04
Identities = 19/23 (82%), Positives = 20/23 (86%)
Frame = +1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
LF +YIYIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 730 LFFIFYIYIYIYIYIYIYIYIYI 798
Score = 41.2 bits (95), Expect = 0.001
Identities = 18/19 (94%), Positives = 18/19 (94%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
YIYIYIYIYIYIYIYI IE
Sbjct: 798 YIYIYIYIYIYIYIYIYIE 742
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.002
Identities = 18/21 (85%), Positives = 18/21 (85%)
Frame = -3
Query: 952 TQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
T YIYIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 813 TDIYIYIYIYIYIYIYIYIYI 751
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.002
Identities = 18/22 (81%), Positives = 18/22 (81%)
Frame = +3
Query: 951 FTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
F YIYIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 741 FLYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI 806
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.003
Identities = 17/21 (80%), Positives = 18/21 (84%)
Frame = +3
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
L+ YIYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 744 LYIYIYIYIYIYIYIYIYIYI 806
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.003
Identities = 16/23 (69%), Positives = 19/23 (82%)
Frame = +2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
++ YIYIYIYIYIYIYIYI +
Sbjct: 746 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYISV 814
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.003
Identities = 17/24 (70%), Positives = 19/24 (78%)
Frame = -3
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
++ YIYIYIYIYIYIYIYI E
Sbjct: 807 IYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIENE 736
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.003
Identities = 17/23 (73%), Positives = 20/23 (86%)
Frame = +2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
L++ + IYIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 728 LYSSFSIYIYIYIYIYIYIYIYI 796
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.23
Identities = 15/24 (62%), Positives = 18/24 (74%)
Frame = -2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
++ YIYIYIYIYIYIY RI+
Sbjct: 799 IYIYIYIYIYIYIYIYIYRK*RIK 728
Score = 31.6 bits (70), Expect = 1.1
Identities = 15/23 (65%), Positives = 16/23 (69%)
Frame = +2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
LF+ Y IYIYIYIYIYI I
Sbjct: 716 LFSWLYSSFSIYIYIYIYIYIYI 784
>TC13352 homologue to GB|AAO64817.1|29028876|BT005882 At3g04570 {Arabidopsis
thaliana;}, partial (6%)
Length = 461
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.002
Identities = 18/31 (58%), Positives = 23/31 (74%)
Frame = -1
Query: 943 QFRGGN*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
QF+G + + IYIYIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 356 QFKGKKEIHQKINIYIYIYIYIYIYIYIDVK 264
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.002
Identities = 19/24 (79%), Positives = 19/24 (79%)
Frame = +3
Query: 947 GN*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
G *L YIYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 249 GE*LNLNIYIYIYIYIYIYIYIYI 320
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.009
Identities = 17/23 (73%), Positives = 19/23 (81%)
Frame = +1
Query: 948 N*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
+*+ T YIYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 256 S*ILTSIYIYIYIYIYIYIYILI 324
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.009
Identities = 16/23 (69%), Positives = 19/23 (82%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIEY*DC 977
YIYIYIYIYIYIYI ++I+ C
Sbjct: 314 YIYIYIYIYIYIYIDVKIQLLTC 246
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.016
Identities = 16/19 (84%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = +3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
IYIYIYIYIYIYIYI I +
Sbjct: 270 IYIYIYIYIYIYIYIYINF 326
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.10
Identities = 14/20 (70%), Positives = 16/20 (80%)
Frame = +3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
YIYIYIYIYIYIYI + +
Sbjct: 279 YIYIYIYIYIYIYINFLVNF 338
Score = 28.9 bits (63), Expect = 7.2
Identities = 11/18 (61%), Positives = 14/18 (77%)
Frame = +1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIY 967
++ YIYIYIYIYI I+
Sbjct: 274 IYIYIYIYIYIYIYILIF 327
>BP056308
Length = 549
Score = 40.8 bits (94), Expect = 0.002
Identities = 17/21 (80%), Positives = 19/21 (89%)
Frame = -1
Query: 948 N*LFTQYYIYIYIYIYIYIYI 968
+* FT YYIYIYIYIYIY+YI
Sbjct: 72 H*FFTMYYIYIYIYIYIYMYI 10
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.38
Identities = 13/16 (81%), Positives = 15/16 (93%)
Frame = +2
Query: 953 QYYIYIYIYIYIYIYI 968
+Y +YIYIYIYIYIYI
Sbjct: 2 EYKMYIYIYIYIYIYI 49
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.86
Identities = 12/20 (60%), Positives = 16/20 (80%)
Frame = -3
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIY 969
L + +YIYIYIYIYIY++
Sbjct: 70 LVFHHVLYIYIYIYIYIYVH 11
Score = 30.8 bits (68), Expect = 1.9
Identities = 11/16 (68%), Positives = 14/16 (86%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYI 970
YIYIYIYIYIY++ +
Sbjct: 49 YIYIYIYIYIYVHFVL 2
Score = 30.8 bits (68), Expect = 1.9
Identities = 11/17 (64%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = -3
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYI 970
++ +YIYIYIYIYIY+
Sbjct: 64 FHHVLYIYIYIYIYIYV 14
Score = 30.4 bits (67), Expect = 2.5
Identities = 12/13 (92%), Positives = 13/13 (99%)
Frame = +2
Query: 958 IYIYIYIYIYIYI 970
+YIYIYIYIYIYI
Sbjct: 11 MYIYIYIYIYIYI 49
Score = 29.3 bits (64), Expect = 5.5
Identities = 11/13 (84%), Positives = 13/13 (99%)
Frame = +1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYI 968
++IYIYIYIYIYI
Sbjct: 13 VHIYIYIYIYIYI 51
Score = 29.3 bits (64), Expect = 5.5
Identities = 11/13 (84%), Positives = 13/13 (99%)
Frame = +1
Query: 958 IYIYIYIYIYIYI 970
++IYIYIYIYIYI
Sbjct: 13 VHIYIYIYIYIYI 51
>BP065348
Length = 486
Score = 40.4 bits (93), Expect = 0.002
Identities = 17/20 (85%), Positives = 18/20 (90%)
Frame = -1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIY 969
LF+ YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 60 LFSTLYIYIYIYIYIYIYIY 1
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 2 YIYIYIYIYIYIYIY 46
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.045
Identities = 15/17 (88%), Positives = 16/17 (93%)
Frame = -3
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYI 970
+ IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 52 HXIYIYIYIYIYIYIYI 2
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 3 IYIYIYIYIYIYIYI 47
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = -3
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRI 972
IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 46 IYIYIYIYIYIYIYI 2
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = +1
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRI 972
IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 1 IYIYIYIYIYIYIYI 45
>BP065663
Length = 457
Score = 40.0 bits (92), Expect = 0.003
Identities = 16/21 (76%), Positives = 18/21 (85%)
Frame = -2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
+F YIYIYIYIYIYIYIY+
Sbjct: 114 IFLNLYIYIYIYIYIYIYIYL 52
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 16/19 (84%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = -1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
IYIYIYIYIYIYIYI + Y
Sbjct: 100 IYIYIYIYIYIYIYIPL*Y 44
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 56 YIYIYIYIYIYIYIY 100
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.045
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = -2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIY+Y
Sbjct: 93 YIYIYIYIYIYIYLY 49
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 14/18 (77%), Positives = 17/18 (93%)
Frame = +1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
+YIYIYIYIYIYIYI ++
Sbjct: 55 VYIYIYIYIYIYIYI*VQ 108
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 57 IYIYIYIYIYIYIYI 101
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.10
Identities = 14/19 (73%), Positives = 16/19 (83%)
Frame = -3
Query: 952 TQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
T YIYIYIYIYIYIY ++
Sbjct: 104 TYIYIYIYIYIYIYIYTFM 48
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.23
Identities = 14/18 (77%), Positives = 16/18 (88%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
YIYIYIYIYIYIY + +I
Sbjct: 62 YIYIYIYIYIYIYKFKKI 115
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.29
Identities = 13/18 (72%), Positives = 15/18 (83%)
Frame = -2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIY 967
L+ YIYIYIYIYIY+Y
Sbjct: 102 LYIYIYIYIYIYIYIYLY 49
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.29
Identities = 15/19 (78%), Positives = 16/19 (83%)
Frame = +3
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
Y+ IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 45 YHKGIYIYIYIYIYIYIYI 101
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.38
Identities = 14/19 (73%), Positives = 16/19 (83%)
Frame = -1
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
++ IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 112 FFELIYIYIYIYIYIYIYI 56
Score = 31.2 bits (69), Expect = 1.5
Identities = 14/18 (77%), Positives = 15/18 (82%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
YIYIYIYIYIYI + RI
Sbjct: 91 YIYIYIYIYIYIPL*YRI 38
Score = 30.0 bits (66), Expect = 3.2
Identities = 12/17 (70%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = -2
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRI 972
I++ +YIYIYIYIYI I
Sbjct: 114 IFLNLYIYIYIYIYIYI 64
Score = 28.9 bits (63), Expect = 7.2
Identities = 12/18 (66%), Positives = 14/18 (77%)
Frame = +1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
+ I +YIYIYIYIYI I
Sbjct: 40 FCIIKVYIYIYIYIYIYI 93
>BP066973
Length = 550
Score = 38.9 bits (89), Expect = 0.007
Identities = 17/26 (65%), Positives = 21/26 (80%)
Frame = +1
Query: 947 GN*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
G *L ++YIYIYIYIYIYIYI++
Sbjct: 331 GY*LACPSHLYIYIYIYIYIYIYIKV 408
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/18 (83%), Positives = 16/18 (88%)
Frame = +1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
YIYIYIYIYIYIYI + I
Sbjct: 361 YIYIYIYIYIYIYIKVTI 414
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.077
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
+IYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 404 FIYIYIYIYIYIYIY 360
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.077
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = -2
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYI 968
+YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 405 FYIYIYIYIYIYIYI 361
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.10
Identities = 15/19 (78%), Positives = 15/19 (78%)
Frame = +3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
IYIYIYIYIYIYIY Y
Sbjct: 360 IYIYIYIYIYIYIYKSYHY 416
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.10
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = -1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
+YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 403 LYIYIYIYIYIYIYI 359
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 14/14 (100%), Positives = 14/14 (100%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYI 968
YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 400 YIYIYIYIYIYIYI 359
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.23
Identities = 17/30 (56%), Positives = 20/30 (66%), Gaps = 5/30 (16%)
Frame = -1
Query: 948 N*LFTQYYIY-----IYIYIYIYIYIYIRI 972
N* T ++ Y +YIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 448 N*FATNFFCY**W*LLYIYIYIYIYIYIYI 359
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.38
Identities = 15/25 (60%), Positives = 17/25 (68%)
Frame = +3
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
L + + IYIYIYIYIYIYI Y
Sbjct: 336 LISMSFPLIYIYIYIYIYIYIYKSY 410
Score = 28.5 bits (62), Expect = 9.5
Identities = 12/19 (63%), Positives = 14/19 (73%)
Frame = +1
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYI 968
L+ YIYIYIYIYI + I
Sbjct: 358 LYIYIYIYIYIYIYIKVTI 414
>BP084236
Length = 164
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.009
Identities = 16/16 (100%), Positives = 16/16 (100%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYI 970
YIYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 162 YIYIYIYIYIYIYIYI 115
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.012
Identities = 15/16 (93%), Positives = 16/16 (99%)
Frame = +1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYI 970
YIYIY+YIYIYIYIYI
Sbjct: 115 YIYIYVYIYIYIYIYI 162
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.016
Identities = 17/21 (80%), Positives = 18/21 (84%)
Frame = +3
Query: 952 TQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
T+ YIYIYI IYIYIYIYI I
Sbjct: 102 TEKYIYIYICIYIYIYIYIYI 164
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/18 (83%), Positives = 16/18 (88%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
YIYIYIYIYIY YIYI +
Sbjct: 164 YIYIYIYIYIYTYIYIYV 111
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 17/24 (70%), Positives = 18/24 (74%)
Frame = +1
Query: 949 *LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
* F Q YIYIY+YIYIYIYI I
Sbjct: 91 *FF*QRSTYIYIYVYIYIYIYIYI 162
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.10
Identities = 13/19 (68%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = -2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIE 973
YIYIYIYI+IYIY+Y ++
Sbjct: 154 YIYIYIYIHIYIYMYFSVK 98
Score = 31.6 bits (70), Expect = 1.1
Identities = 11/22 (50%), Positives = 17/22 (77%)
Frame = -2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIR 971
++ YIYIYI+IYIY+Y ++
Sbjct: 163 IYIYIYIYIYIHIYIYMYFSVK 98
>TC19778 similar to UP|Q9LNJ1 (Q9LNJ1) F6F3.12 protein, partial (5%)
Length = 505
Score = 38.5 bits (88), Expect = 0.009
Identities = 16/19 (84%), Positives = 17/19 (89%)
Frame = +3
Query: 952 TQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
T Y +YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 240 TAYCLYIYIYIYIYIYIYI 296
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.016
Identities = 15/16 (93%), Positives = 16/16 (99%)
Frame = -1
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIY 969
+YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 301 WYIYIYIYIYIYIYIY 254
Score = 37.4 bits (85), Expect = 0.020
Identities = 16/20 (80%), Positives = 17/20 (85%)
Frame = +3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
YIYIYIYIYIYIYIY + Y
Sbjct: 255 YIYIYIYIYIYIYIYHQRAY 314
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/16 (93%), Positives = 16/16 (99%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYI 970
+IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 251 FIYIYIYIYIYIYIYI 298
Score = 36.6 bits (83), Expect = 0.035
Identities = 16/19 (84%), Positives = 16/19 (84%)
Frame = -2
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIYI 968
LF YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 309 LFDGIYIYIYIYIYIYIYI 253
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = -2
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 297 IYIYIYIYIYIYIYI 253
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.077
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = -3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
+YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 299 VYIYIYIYIYIYIYI 255
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 15/21 (71%), Positives = 15/21 (71%)
Frame = +1
Query: 947 GN*LFTQYYIYIYIYIYIYIY 967
G L YIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 235 GTRLIVYIYIYIYIYIYIYIY 297
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 14/17 (82%), Positives = 16/17 (93%)
Frame = +2
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRI 972
++IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 248 LFIYIYIYIYIYIYIYI 298
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.38
Identities = 15/20 (75%), Positives = 15/20 (75%)
Frame = -2
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRIEY*DC 977
IYIYIYIYIYIYI I C
Sbjct: 297 IYIYIYIYIYIYIYINNKPC 238
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 13/17 (76%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = +1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRI 972
+ +YIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 244 LIVYIYIYIYIYIYIYI 294
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 13/17 (76%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = -3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRI 972
+ +YIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 305 LMVYIYIYIYIYIYIYI 255
Score = 30.8 bits (68), Expect = 1.9
Identities = 15/24 (62%), Positives = 17/24 (70%), Gaps = 1/24 (4%)
Frame = +3
Query: 950 LFTQYYIYIYIYIYIYIY-IYIRI 972
L+ YIYIYIYIYIY Y+RI
Sbjct: 252 LYIYIYIYIYIYIYIYHQRAYVRI 323
>TC11523 UP|Q7PHQ1 (Q7PHQ1) ENSANGP00000024044 (Fragment), partial (11%)
Length = 467
Score = 38.1 bits (87), Expect = 0.012
Identities = 16/23 (69%), Positives = 20/23 (86%)
Frame = +3
Query: 948 N*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYI 970
N*LF ++ + IYIYIYIYIYIY+
Sbjct: 294 N*LFLRFLLCIYIYIYIYIYIYL 362
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 17/31 (54%), Positives = 19/31 (60%)
Frame = -2
Query: 941 NLQFRGGN*LFTQYYIYIYIYIYIYIYIYIR 971
NLQF+ YIYIYIYIYIYI+ R
Sbjct: 373 NLQFK-----------YIYIYIYIYIYIHSR 314
Score = 30.0 bits (66), Expect = 3.2
Identities = 13/19 (68%), Positives = 14/19 (73%)
Frame = -2
Query: 947 GN*LFTQYYIYIYIYIYIY 965
GN F YIYIYIYIYI+
Sbjct: 376 GNLQFKYIYIYIYIYIYIH 320
Score = 28.5 bits (62), Expect = 9.5
Identities = 13/22 (59%), Positives = 16/22 (72%)
Frame = +1
Query: 951 FTQYYIYIYIYIYIYIYIYIRI 972
F+ +Y +YIYIYIYIYI I
Sbjct: 304 FSDFYC---VYIYIYIYIYIYI 360
>TC11768
Length = 674
Score = 37.7 bits (86), Expect = 0.016
Identities = 16/16 (100%), Positives = 16/16 (100%)
Frame = -1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIR 971
IYIYIYIYIYIYIYIR
Sbjct: 674 IYIYIYIYIYIYIYIR 627
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 630 YIYIYIYIYIYIYIY 674
Score = 36.2 bits (82), Expect = 0.045
Identities = 15/18 (83%), Positives = 16/18 (88%)
Frame = +2
Query: 951 FTQYYIYIYIYIYIYIYI 968
F+ YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 620 FSPLYIYIYIYIYIYIYI 673
Score = 35.0 bits (79), Expect = 0.10
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
+YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 629 LYIYIYIYIYIYIYI 673
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 14/14 (100%), Positives = 14/14 (100%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYI 968
YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 671 YIYIYIYIYIYIYI 630
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 14/14 (100%), Positives = 14/14 (100%)
Frame = -2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYI 968
YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 673 YIYIYIYIYIYIYI 632
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = -1
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRI 972
IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 674 IYIYIYIYIYIYIYI 630
Score = 31.6 bits (70), Expect = 1.1
Identities = 13/15 (86%), Positives = 14/15 (92%)
Frame = +2
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRI 972
+YIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 629 LYIYIYIYIYIYIYI 673
>AV772980
Length = 497
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 497 YIYIYIYIYIYIYIY 453
Score = 37.0 bits (84), Expect = 0.027
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 452 YIYIYIYIYIYIYIY 496
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = -2
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 496 IYIYIYIYIYIYIYI 452
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 15/15 (100%), Positives = 15/15 (100%)
Frame = +3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
IYIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 453 IYIYIYIYIYIYIYI 497
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.077
Identities = 15/17 (88%), Positives = 15/17 (88%)
Frame = +2
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYI 970
Y YIYIYIYIYIYIYI
Sbjct: 443 YIPYIYIYIYIYIYIYI 493
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = +3
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRI 972
IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 453 IYIYIYIYIYIYIYI 497
Score = 32.3 bits (72), Expect = 0.65
Identities = 14/15 (93%), Positives = 14/15 (93%)
Frame = -2
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRI 972
IYIYIYIYIYIYI I
Sbjct: 496 IYIYIYIYIYIYIYI 452
>BP065838
Length = 425
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 20/33 (60%), Positives = 22/33 (66%), Gaps = 1/33 (3%)
Frame = +1
Query: 943 QFRGGN*LFTQYYIYIYIYIYIYIY-IYIRIEY 974
Q R N* YIYIYIYIYIY+Y IYI I +
Sbjct: 85 QQRDTN*HVLPIYIYIYIYIYIYLYNIYIYIYF 183
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 14/16 (87%), Positives = 15/16 (93%)
Frame = -2
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIY 969
YYI IYIYIYIYIYI+
Sbjct: 163 YYINIYIYIYIYIYIW 116
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.29
Identities = 13/17 (76%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = -1
Query: 954 YYIYIYIYIYIYIYIYI 970
Y +Y YIYIYIYIYIY+
Sbjct: 167 YILYKYIYIYIYIYIYM 117
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.38
Identities = 16/19 (84%), Positives = 16/19 (84%), Gaps = 3/19 (15%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYI---YIYIYIYIYI 970
YIYIYI YIYIYIYIYI
Sbjct: 177 YIYIYII*IYIYIYIYIYI 121
Score = 33.1 bits (74), Expect = 0.38
Identities = 16/19 (84%), Positives = 16/19 (84%), Gaps = 3/19 (15%)
Frame = -2
Query: 955 YIYIY---IYIYIYIYIYI 970
YIYIY IYIYIYIYIYI
Sbjct: 175 YIYIYYINIYIYIYIYIYI 119
Score = 32.0 bits (71), Expect = 0.86
Identities = 16/19 (84%), Positives = 16/19 (84%), Gaps = 1/19 (5%)
Frame = -1
Query: 955 YIYIYI-YIYIYIYIYIRI 972
YIYIYI Y YIYIYIYI I
Sbjct: 179 YIYIYILYKYIYIYIYIYI 123
Score = 31.2 bits (69), Expect = 1.5
Identities = 16/20 (80%), Positives = 16/20 (80%), Gaps = 3/20 (15%)
Frame = -2
Query: 956 IYIYIY---IYIYIYIYIRI 972
IYIYIY IYIYIYIYI I
Sbjct: 178 IYIYIYYINIYIYIYIYIYI 119
Score = 31.2 bits (69), Expect = 1.5
Identities = 16/20 (80%), Positives = 16/20 (80%), Gaps = 3/20 (15%)
Frame = -3
Query: 956 IYIYIY---IYIYIYIYIRI 972
IYIYIY IYIYIYIYI I
Sbjct: 180 IYIYIYII*IYIYIYIYIYI 121
Score = 28.5 bits (62), Expect = 9.5
Identities = 12/21 (57%), Positives = 16/21 (76%), Gaps = 1/21 (4%)
Frame = +2
Query: 950 LFTQYYIYIYI-YIYIYIYIY 969
++ YIYIYI YIYIYI+ +
Sbjct: 128 IYIYIYIYIYIIYIYIYIFFF 190
>BP056651
Length = 564
Score = 35.8 bits (81), Expect = 0.059
Identities = 26/100 (26%), Positives = 43/100 (43%), Gaps = 4/100 (4%)
Frame = +1
Query: 641 DFCFAPARNNRSGGIAYFWRN---TVNCSIVNYSANHISAKIEEVSRSAWTFTGFYGYPE 697
D+ PA+ R+GG+ W+ TV + + K + VS Y
Sbjct: 76 DWRMIPAKE-RAGGLLCVWKPSVFTVEECFLGEGFLGLKGKWKGVS---CVIINVYSPCS 243
Query: 698 IARRRDSWNFIRGLARQINLP-WCQMGDFNDILHSDEKKG 736
+R W ++ L R++ WC GDFN + S+E++G
Sbjct: 244 RGEKRQLWEDLKALRRRLEEDIWCMAGDFNSVRRSEERRG 363
>TC15556 similar to UP|AAS51733 (AAS51733) ADL187Wp, partial (8%)
Length = 695
Score = 35.4 bits (80), Expect = 0.077
Identities = 14/15 (93%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIYI+
Sbjct: 389 YIYIYIYIYIYIYIF 433
Score = 34.7 bits (78), Expect = 0.13
Identities = 13/15 (86%), Positives = 15/15 (99%)
Frame = +1
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYI 970
+YIYIYIYIYIYIY+
Sbjct: 388 VYIYIYIYIYIYIYL 432
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 15/19 (78%), Positives = 16/19 (83%)
Frame = +3
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRIEY*D 976
IYIYIYIYIYIYI + *D
Sbjct: 390 IYIYIYIYIYIYISLSI*D 446
Score = 34.3 bits (77), Expect = 0.17
Identities = 14/14 (100%), Positives = 14/14 (100%)
Frame = -3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIY 969
IYIYIYIYIYIYIY
Sbjct: 429 IYIYIYIYIYIYIY 388
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.23
Identities = 15/20 (75%), Positives = 15/20 (75%)
Frame = -3
Query: 958 IYIYIYIYIYIYIRIEY*DC 977
IYIYIYIYIYIYI Y C
Sbjct: 429 IYIYIYIYIYIYIYFFYFKC 370
Score = 33.9 bits (76), Expect = 0.23
Identities = 13/15 (86%), Positives = 14/15 (92%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIYIY +
Sbjct: 426 YIYIYIYIYIYIYFF 382
Score = 33.5 bits (75), Expect = 0.29
Identities = 13/17 (76%), Positives = 16/17 (93%)
Frame = +2
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYIR 971
YIYIYIYIYIYI+ ++R
Sbjct: 395 YIYIYIYIYIYIFKHLR 445
Score = 32.7 bits (73), Expect = 0.50
Identities = 14/17 (82%), Positives = 15/17 (87%)
Frame = +3
Query: 956 IYIYIYIYIYIYIYIRI 972
IYIYIYIYIYIYI + I
Sbjct: 390 IYIYIYIYIYIYISLSI 440
Score = 30.8 bits (68), Expect = 1.9
Identities = 14/23 (60%), Positives = 16/23 (68%)
Frame = -3
Query: 952 TQYYIYIYIYIYIYIYIYIRIEY 974
T Y + IYIYIYIYIYI I +
Sbjct: 453 TSYLRCLKIYIYIYIYIYIYIYF 385
Score = 30.8 bits (68), Expect = 1.9
Identities = 13/16 (81%), Positives = 14/16 (87%)
Frame = +3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIYI 970
YIYIYIYIYIYI + I
Sbjct: 393 YIYIYIYIYIYISLSI 440
Score = 30.4 bits (67), Expect = 2.5
Identities = 11/15 (73%), Positives = 13/15 (86%)
Frame = -3
Query: 955 YIYIYIYIYIYIYIY 969
YIYIYIYIYIY + +
Sbjct: 420 YIYIYIYIYIYFFYF 376
Database: LJGI
Posted date: Jul 30, 2004 11:16 AM
Number of letters in database: 14,692,800
Number of sequences in database: 28,460
Lambda K H
0.357 0.159 0.586
Gapped
Lambda K H
0.267 0.0410 0.140
Matrix: BLOSUM62
Gap Penalties: Existence: 11, Extension: 1
Number of Hits to DB: 31,411,664
Number of Sequences: 28460
Number of extensions: 465679
Number of successful extensions: 8130
Number of sequences better than 10.0: 65
Number of HSP's better than 10.0 without gapping: 3971
Number of HSP's successfully gapped in prelim test: 113
Number of HSP's that attempted gapping in prelim test: 1224
Number of HSP's gapped (non-prelim): 5810
length of query: 1735
length of database: 4,897,600
effective HSP length: 103
effective length of query: 1632
effective length of database: 1,966,220
effective search space: 3208871040
effective search space used: 3208871040
frameshift window, decay const: 50, 0.1
T: 13
A: 40
X1: 14 ( 7.2 bits)
X2: 38 (14.6 bits)
X3: 64 (24.7 bits)
S1: 37 (21.7 bits)
S2: 62 (28.5 bits)
Medicago: description of AC134322.4